More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3337 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  63.71 
 
 
547 aa  738  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  71.32 
 
 
533 aa  811  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  85.44 
 
 
535 aa  963  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0325  CTP synthetase  64.39 
 
 
534 aa  726  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  7.36967e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  58.47 
 
 
545 aa  640  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.22232e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18211  CTP synthetase  63.26 
 
 
555 aa  723  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  61.12 
 
 
533 aa  694  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  64.97 
 
 
534 aa  757  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  59 
 
 
553 aa  664  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1754  CTP synthetase  58.38 
 
 
652 aa  660  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206256  hitchhiker  0.00103098 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  58.66 
 
 
546 aa  642  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  64.78 
 
 
555 aa  732  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  2.64859e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  57.3 
 
 
542 aa  645  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  66.79 
 
 
540 aa  746  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  85.82 
 
 
535 aa  966  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1236  CTP synthetase  58.66 
 
 
545 aa  642  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.61678e-07  hitchhiker  2.00253e-09 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1325  CTP synthetase  61.32 
 
 
536 aa  700  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00186219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  86.2 
 
 
535 aa  969  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  61.55 
 
 
533 aa  660  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  57.12 
 
 
534 aa  675  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  59.55 
 
 
535 aa  645  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  55.56 
 
 
533 aa  647  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  66.35 
 
 
537 aa  746  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3351  CTP synthetase  58.43 
 
 
545 aa  634  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.38422e-06  hitchhiker  2.52338e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  57.67 
 
 
542 aa  646  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  3.00969e-05 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2106  CTP synthetase  59.09 
 
 
533 aa  667  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0473416  normal  0.014711 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  86.01 
 
 
535 aa  970  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  70.89 
 
 
533 aa  808  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  1.27982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  60.93 
 
 
533 aa  691  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  58.55 
 
 
545 aa  642  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18801  CTP synthetase  61.74 
 
 
536 aa  711  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  58.47 
 
 
545 aa  640  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.12535e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  69.81 
 
 
542 aa  800  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  57.44 
 
 
555 aa  635  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29581  CTP synthetase  62.31 
 
 
558 aa  714  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21631  CTP synthetase  63.07 
 
 
555 aa  727  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.397558 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18801  CTP synthetase  61.74 
 
 
536 aa  704  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18991  CTP synthetase  61.55 
 
 
536 aa  711  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.433411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  58.66 
 
 
545 aa  642  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.21418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1217  CTP synthetase  59.81 
 
 
544 aa  660  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  58.47 
 
 
545 aa  640  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.10473e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  56.48 
 
 
542 aa  643  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  60.56 
 
 
533 aa  688  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0174  CTP synthetase  59.55 
 
 
542 aa  674  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.472124  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0028  CTP synthetase  60 
 
 
534 aa  676  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.23296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  74.39 
 
 
536 aa  835  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  64.97 
 
 
557 aa  737  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  1.24409e-06  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  69.81 
 
 
534 aa  784  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.81921e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  57.3 
 
 
542 aa  646  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  74.39 
 
 
536 aa  835  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  59.74 
 
 
534 aa  638  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  58.04 
 
 
551 aa  652  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  62.19 
 
 
558 aa  724  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  62.95 
 
 
545 aa  722  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  59.59 
 
 
530 aa  678  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22080  CTP synthase  58.1 
 
 
554 aa  645  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202828  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2035  CTP synthase  62.76 
 
 
533 aa  713  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00063614  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0040  CTP synthase  62.19 
 
 
531 aa  689  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2836  CTP synthase  58.58 
 
 
559 aa  637  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0206831  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  57.3 
 
 
563 aa  637  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  56.36 
 
 
555 aa  642  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  58.6 
 
 
549 aa  645  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  93.03 
 
 
531 aa  1042  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  66.54 
 
 
547 aa  754  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4064  CTP synthetase  56.38 
 
 
583 aa  636  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.541211  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  61.39 
 
 
559 aa  706  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1347  CTP synthase  57.91 
 
 
560 aa  643  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08471  CTP synthetase  55.6 
 
 
539 aa  637  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.859496  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0969  CTP synthase  58.1 
 
 
546 aa  649  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538068  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1487  CTP synthase  60.63 
 
 
558 aa  657  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.883119  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2240  CTP synthase  60.6 
 
 
538 aa  674  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.480031  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  59.02 
 
 
545 aa  651  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4432  CTP synthase  56.07 
 
 
587 aa  635  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281255  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  57.59 
 
 
555 aa  643  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3086  CTP synthase  61.73 
 
 
571 aa  655  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716725  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2015  CTP synthase  57.28 
 
 
565 aa  645  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2990  CTP synthase  59.25 
 
 
563 aa  639  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781575  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1191  CTP synthetase  59.62 
 
 
544 aa  658  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  60.74 
 
 
546 aa  674  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  71 
 
 
536 aa  802  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  5.43339e-08  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  100 
 
 
531 aa  1098  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  71.08 
 
 
541 aa  811  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  59.52 
 
 
547 aa  665  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  67.79 
 
 
535 aa  773  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  67.49 
 
 
534 aa  775  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1518  CTP synthetase  58.02 
 
 
587 aa  638  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.85327e-07 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1387  CTP synthetase  63.07 
 
 
549 aa  703  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  63.4 
 
 
547 aa  715  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  70.51 
 
 
532 aa  797  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  86.39 
 
 
535 aa  971  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.67112e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  86.01 
 
 
535 aa  967  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  4.97505e-06  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  61.74 
 
 
533 aa  662  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  56.25 
 
 
554 aa  650  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  67.61 
 
 
538 aa  762  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0475  CTP synthetase  61.19 
 
 
549 aa  684  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.984094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1132  CTP synthetase  57.25 
 
 
558 aa  649  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  59.55 
 
 
546 aa  653  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09600  CTP synthetase  61.13 
 
 
532 aa  684  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0671161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08750  CTP synthetase  61.02 
 
 
535 aa  682  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  unclonable  1.94145e-09 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  57.84 
 
 
539 aa  650  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>