237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3308 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 
70 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.66069e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  80 
 
 
72 aa  107  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  78.57 
 
 
72 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  78.57 
 
 
72 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  78.57 
 
 
72 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  78.57 
 
 
72 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  78.57 
 
 
72 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  78.57 
 
 
72 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  78.57 
 
 
72 aa  106  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  78.57 
 
 
72 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.62288e-05  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  78.57 
 
 
72 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  78.57 
 
 
72 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  81.82 
 
 
70 aa  100  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  81.82 
 
 
70 aa  100  8e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  81.82 
 
 
70 aa  100  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  67.16 
 
 
79 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  80 
 
 
72 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  60.32 
 
 
77 aa  82.4  2e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  53.85 
 
 
70 aa  73.2  1e-12  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  63.46 
 
 
77 aa  72.8  2e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  49.25 
 
 
76 aa  69.7  1e-11  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  60.42 
 
 
85 aa  69.3  2e-11  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  50.79 
 
 
81 aa  68.6  3e-11  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  52.38 
 
 
77 aa  67.4  6e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  54.1 
 
 
78 aa  67.4  7e-11  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
76 aa  65.9  2e-10  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  53.33 
 
 
74 aa  65.5  3e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 
77 aa  63.2  1e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4796  ATP synthase F0, C subunit  70.27 
 
 
76 aa  62  3e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.70119e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  47.76 
 
 
91 aa  61.6  4e-09  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  47.76 
 
 
91 aa  61.2  4e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.50029e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  49.18 
 
 
81 aa  60.5  7e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  47.76 
 
 
91 aa  60.5  8e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.4416e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  47.76 
 
 
91 aa  60.5  8e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  55.77 
 
 
95 aa  58.9  2e-08  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  2.2409e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
68 aa  59.3  2e-08  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  41.43 
 
 
74 aa  59.3  2e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
76 aa  58.9  2e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0462  ATP synthase F0, C subunit  61.36 
 
 
72 aa  58.9  3e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00357731  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  52.31 
 
 
94 aa  58.5  3e-08  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.56588e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  55.56 
 
 
82 aa  58.5  3e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  50.77 
 
 
82 aa  58.2  4e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  5.0881e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  50.77 
 
 
82 aa  58.2  4e-08  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  9.4823e-07  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  50.88 
 
 
75 aa  57.8  5e-08  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  47.69 
 
 
81 aa  56.6  1e-07  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  50 
 
 
74 aa  56.2  1e-07  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 
91 aa  55.8  2e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.92065e-05  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  46.38 
 
 
84 aa  55.8  2e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 
122 aa  55.8  2e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  46.27 
 
 
78 aa  55.5  2e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 
82 aa  55.8  2e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  44.93 
 
 
75 aa  55.5  2e-07  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.61135e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  46.38 
 
 
84 aa  55.8  2e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 
91 aa  56.2  2e-07  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 
91 aa  55.8  2e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 
82 aa  55.8  2e-07  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  47.62 
 
 
84 aa  55.1  3e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  50.82 
 
 
70 aa  55.1  3e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  41.94 
 
 
73 aa  55.1  3e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  48.44 
 
 
103 aa  55.5  3e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  48.33 
 
 
69 aa  55.5  3e-07  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  47.62 
 
 
84 aa  55.1  3e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.13686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
71 aa  55.5  3e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2802  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
79 aa  55.1  4e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0121478  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 
81 aa  54.7  4e-07  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 
81 aa  54.7  4e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  45.16 
 
 
75 aa  55.1  4e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  46.77 
 
 
111 aa  54.7  4e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 
81 aa  54.7  4e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 
81 aa  54.7  4e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.54 
 
 
77 aa  54.3  6e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  4.06172e-05 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 
91 aa  54.3  6e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3058  F0F1 ATP synthase subunit C  51.56 
 
 
91 aa  53.9  7e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  46.27 
 
 
78 aa  53.9  7e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2915  F0F1 ATP synthase subunit C  51.56 
 
 
91 aa  53.9  7e-07  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  46.03 
 
 
92 aa  53.9  8e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  46.03 
 
 
85 aa  53.5  8e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 
75 aa  53.1  1e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  46.03 
 
 
85 aa  53.5  1e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.05757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  43.28 
 
 
73 aa  53.5  1e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  3.18758e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1874  F0F1-type ATP synthase, subunit c  51.11 
 
 
75 aa  53.5  1e-06  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 
75 aa  53.1  1e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4612  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 
75 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  44.78 
 
 
73 aa  53.1  1e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.3986e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
88 aa  52.4  2e-06  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  51.67 
 
 
75 aa  52  3e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  6.66006e-11 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4245  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 
85 aa  51.6  3e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.28569e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 
83 aa  51.6  3e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  46.43 
 
 
77 aa  52  3e-06  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3930  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 
83 aa  51.2  4e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0039435  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3850  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 
83 aa  51.6  4e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0401321  hitchhiker  2.55174e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  41.94 
 
 
74 aa  51.2  4e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6361  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 
85 aa  51.2  4e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4491  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 
83 aa  51.6  4e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000555437  hitchhiker  4.7604e-06 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5436  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 
85 aa  51.2  4e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4370  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 
83 aa  51.2  4e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00324113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5735  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 
85 aa  51.2  4e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000209098  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  53.06 
 
 
73 aa  51.6  4e-06  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5300  F0F1 ATP synthase subunit C  50.82 
 
 
85 aa  51.2  4e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371709  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5604  ATP synthase F0, C subunit  50.82 
 
 
85 aa  51.6  4e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>