More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3300 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3300  NADH dehydrogenase subunit B  100 
 
 
170 aa  353  8.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3412  NADH dehydrogenase subunit B  89.41 
 
 
170 aa  317  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3818  NADH dehydrogenase subunit B  85.21 
 
 
172 aa  311  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5420  NADH dehydrogenase subunit B  85.21 
 
 
172 aa  310  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5424  NADH dehydrogenase subunit B  85.21 
 
 
172 aa  310  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5149  NADH dehydrogenase subunit B  85.21 
 
 
179 aa  310  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4981  NADH dehydrogenase subunit B  85.21 
 
 
179 aa  310  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4999  NADH dehydrogenase subunit B  85.21 
 
 
179 aa  310  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5541  NADH dehydrogenase subunit B  85.21 
 
 
172 aa  310  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5475  NADH dehydrogenase subunit B  85.21 
 
 
172 aa  310  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5390  NADH dehydrogenase subunit B  85.21 
 
 
172 aa  310  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90605e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5530  NADH dehydrogenase subunit B  85.21 
 
 
172 aa  309  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000187843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5097  NADH dehydrogenase subunit B  84.62 
 
 
172 aa  308  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2835  NADH dehydrogenase subunit B  68.03 
 
 
158 aa  216  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2704  NADH dehydrogenase subunit B  68.03 
 
 
158 aa  216  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3750  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 
173 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.75959e-16  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04297  NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit B, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G05860)  61.04 
 
 
228 aa  211  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300852  hitchhiker  0.000000856245 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1282  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60.12 
 
 
179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1050  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
160 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0822  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
160 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3137  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.38 
 
 
169 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000706512  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1876  NADH-quinone oxidoreductase B subunit  59.88 
 
 
179 aa  210  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.522368  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1300  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
159 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0736  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
159 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1291  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
159 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0414  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
159 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1131  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
159 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336048  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2830  NADH dehydrogenase subunit B  62.25 
 
 
184 aa  210  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.156241  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1828  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
173 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165707  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1436  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
173 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1062  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
173 aa  209  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0102283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4009  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 
170 aa  209  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02735e-29 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0709  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.83 
 
 
158 aa  209  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.914683  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0270  NADH dehydrogenase subunit B  61.59 
 
 
184 aa  208  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2564  NADH dehydrogenase subunit B  64.14 
 
 
158 aa  209  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5576  NADH dehydrogenase subunit B  65.52 
 
 
159 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000095063  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3925  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  60 
 
 
170 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000298768  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2272  NADH dehydrogenase subunit B  65.52 
 
 
159 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000536448  normal  0.140602 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2165  NADH dehydrogenase subunit B  65.52 
 
 
159 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00589075  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1636  NADH dehydrogenase subunit B  65.52 
 
 
159 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000193471  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1633  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.76 
 
 
251 aa  209  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514076  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1029  NADH dehydrogenase subunit B  65.52 
 
 
159 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000403774  normal  0.211047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2286  NADH dehydrogenase subunit B  65.52 
 
 
159 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000148952  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2248  NADH dehydrogenase subunit B  65.52 
 
 
159 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00315965  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0241  NADH dehydrogenase subunit B  61.59 
 
 
184 aa  208  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0910  NADH dehydrogenase subunit B  62.03 
 
 
178 aa  208  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.617047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0818  NADH dehydrogenase subunit B  64.83 
 
 
158 aa  207  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00543659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4243  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  61.29 
 
 
170 aa  207  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3213  NADH dehydrogenase subunit B  64.83 
 
 
159 aa  207  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00737859  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1344  NADH dehydrogenase subunit B  64.83 
 
 
159 aa  207  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000452822  hitchhiker  0.00283492 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01288  NADH dehydrogenase subunit B  60.93 
 
 
182 aa  207  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2008  NADH dehydrogenase subunit B  64.83 
 
 
159 aa  207  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000826192  normal  0.49233 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1890  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
160 aa  207  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103149  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2213  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
160 aa  207  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.444713 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0339  NADH dehydrogenase I, B subunit  60 
 
 
170 aa  207  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000262724  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2061  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
160 aa  207  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.061977  normal  0.162166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3634  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  58.86 
 
 
167 aa  206  9e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.608581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3509  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
159 aa  206  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1617  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
161 aa  206  1e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.025993  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1963  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.45 
 
 
159 aa  206  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000504024  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1404  NADH dehydrogenase subunit B  60.53 
 
 
158 aa  206  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0763346  normal  0.811517 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3622  NADH dehydrogenase subunit B  60.67 
 
 
167 aa  206  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.623908  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1969  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.45 
 
 
158 aa  206  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0170292 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0546  NADH dehydrogenase subunit B  62.09 
 
 
161 aa  206  1e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0962  NADH dehydrogenase subunit B  60.78 
 
 
160 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0673529  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2042  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
158 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2629  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
158 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2256  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
158 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000211515 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2411  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
158 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0987  NADH dehydrogenase subunit B  62.76 
 
 
158 aa  205  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.739675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0978  NADH dehydrogenase subunit B  63.01 
 
 
166 aa  205  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0928  NADH dehydrogenase subunit B  60.13 
 
 
160 aa  205  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0103047  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0139  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  59.09 
 
 
169 aa  204  4e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1809  hypothetical protein  69.72 
 
 
173 aa  204  5e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0288  NADH dehydrogenase subunit B  63.57 
 
 
185 aa  203  9e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0629592  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_41645  predicted protein  58.44 
 
 
166 aa  203  9e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296406  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2388  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  64.71 
 
 
225 aa  203  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02800  conserved hypothetical protein  56.88 
 
 
250 aa  203  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0950  NADH dehydrogenase subunit B  63.45 
 
 
158 aa  202  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0972476  normal  0.726219 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0787  NADH dehydrogenase subunit B  64.03 
 
 
179 aa  203  1e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1502  NADH dehydrogenase subunit B  58.55 
 
 
158 aa  203  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0088151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2060  NADH dehydrogenase subunit B  62.76 
 
 
158 aa  202  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3354  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 20 kDa subunit  58.39 
 
 
170 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000291107  hitchhiker  0.00879289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2990  NADH dehydrogenase subunit B  58.44 
 
 
268 aa  202  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484766  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1764  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  62.76 
 
 
158 aa  201  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.381337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1425  NADH dehydrogenase subunit B  61.38 
 
 
159 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.301169  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1048  NADH dehydrogenase subunit B  61.33 
 
 
174 aa  201  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.675921  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1092  NADH dehydrogenase subunit B  60.69 
 
 
158 aa  201  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2089  NADH dehydrogenase subunit B  59.86 
 
 
268 aa  201  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75518  NADH-ubiquinone oxidoreductase  63.04 
 
 
207 aa  201  6e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.228639  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1143  NADH dehydrogenase subunit B  62.07 
 
 
158 aa  201  6e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0196074  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0873  NADH dehydrogenase subunit B  62.33 
 
 
159 aa  200  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.650133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1556  NADH dehydrogenase subunit B  61.11 
 
 
185 aa  200  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3255  NADH dehydrogenase subunit B  63.04 
 
 
159 aa  200  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.551584  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0958  NADH dehydrogenase subunit B  62.33 
 
 
159 aa  200  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000268179 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1657  NADH dehydrogenase subunit B  61.81 
 
 
170 aa  200  8e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5179  NADH dehydrogenase subunit B  62.33 
 
 
159 aa  200  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0744  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  63.69 
 
 
191 aa  200  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.167949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6093  NADH dehydrogenase subunit B  58.86 
 
 
264 aa  200  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.024124 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0431  NADH dehydrogenase subunit B  65.94 
 
 
167 aa  200  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>