More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3205 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
306 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.91 
 
 
310 aa  394  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  30.8 
 
 
303 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  30.47 
 
 
303 aa  99  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  30.11 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  29.71 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  30.11 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  30.11 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  29.71 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  29.75 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  29.75 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  29.5 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1069  hypothetical protein  25.65 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.113736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  29.75 
 
 
303 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.88 
 
 
283 aa  93.6  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
301 aa  92.4  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  25.88 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.06 
 
 
306 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 
304 aa  89  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.55 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.14 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  28.85 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  27.08 
 
 
308 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  28.37 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.61 
 
 
306 aa  87  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 
349 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  24.92 
 
 
306 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  27.36 
 
 
301 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  27.37 
 
 
331 aa  85.9  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  29.51 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.2 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05223  hypothetical protein  27.1 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  27.14 
 
 
300 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.3 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.67 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.06 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.22 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  26.69 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.99 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  28.81 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  24.14 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  25.49 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25.32 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  24.14 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  26.35 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  24.84 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  26.89 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  25.85 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 
289 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001333  hypothetical protein  26.35 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000132961  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.18 
 
 
303 aa  79  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.18 
 
 
303 aa  79  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.17 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.52 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25.25 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.29 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.67 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0743  hypothetical protein  24.05 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4387  EamA family protein  25.48 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4605  transporter, EamA family  25.48 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4240  drug/metabolite exporter family protein  25.48 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  27.62 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4726  eama family protein  25.48 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  26.9 
 
 
300 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  29.1 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.54 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1612  integral membrane protein  25.26 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  28.73 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  25.43 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  24.82 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1212  hypothetical protein  24.43 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  25.72 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  26.12 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  25.99 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  25.26 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  25.35 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  25.72 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  26.76 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  26.39 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.18 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  26.42 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  24.91 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  24.82 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  26.42 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>