More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3148 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 310 aa  640    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  51.63 
 
 		 307 aa  322  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 291 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  31.23 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  49.28 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  33.66 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 231 aa  68.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
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NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 197 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 212 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 184 aa  67  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 207 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 212 aa  67  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  32.69 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  34.62 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 194 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
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NC_013510  Tcur_0815  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 204 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
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NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  27.5 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
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NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
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NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
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NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  34.21 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  34.95 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 193 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 182 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  31.76 
 
 		 237 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 201 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 211 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 196 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
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NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 206 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
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NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
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