82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3061 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 124 aa  253  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  62.5 
 
 		 109 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  55.67 
 
 		 111 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  51.49 
 
 		 115 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  51.46 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  51.58 
 
 		 109 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.71 
 
 		 111 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  48.54 
 
 		 113 aa  100  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  51.58 
 
 		 113 aa  99.4  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  52.69 
 
 		 110 aa  96.7  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.49 
 
 		 115 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  51.55 
 
 		 108 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.74 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.74 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.12 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  42.86 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.86 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  42.86 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  42.86 
 
 		 111 aa  85.9  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  42.86 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  42.86 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  41.9 
 
 		 111 aa  84  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.27 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  42.57 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.6 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4869  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.68 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536474  unclonable  0.0000000999645 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  36.52 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.66 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5408  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.71 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  38.1 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.11 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1479  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.13 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.937669  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  43.16 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  43.16 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  43.16 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  43.16 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3307  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  57.78 
 
 		 48 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  39.56 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  31.46 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  33.9 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  33.06 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2885  PemK family protein  34.78 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.670266  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3376  toxin ChpB  38.54 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00160549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5698  toxin ChpB  34 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783517  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3768  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.7 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.41 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2583  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3503  plasmid stable inheritance protein K  34.38 
 
 		 103 aa  48.1  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.77 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  31.13 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.67 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  27.18 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.84 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.4 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.32 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.47 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.12 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9913  plasmid stable inheritance protein K  25 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.703725  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  30 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0785  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.98 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0655537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1630  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.46 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1876  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.74 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1191  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.7 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.325689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.62 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0962  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.37 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5455  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.92 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  29.25 
 
 		 110 aa  42  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.93 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1483  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.11 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  27.88 
 
 		 110 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3386  PemK family protein  28.28 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474418  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.91 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.23 
 
 		 123 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  31.91 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  31.91 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.55 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2143  PemK family protein  29.55 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.97 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>