110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3052 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3052  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  233  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  47.06 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3453  hypothetical protein  46.23 
 
 		 113 aa  90.9  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0573  hypothetical protein  40.54 
 
 		 118 aa  90.1  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1892  hypothetical protein  43.22 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.156341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2226  putative small multidrug resistance transmembrane protein  39.81 
 
 		 112 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.545131  hitchhiker  0.00000175504 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  40.87 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  31.97 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  33.88 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  35.19 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  36.08 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  35.29 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  36.52 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  36.52 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5055  transporter  34.21 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5060  transporter  34.21 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  33.06 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5929  hypothetical protein  39.58 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5159  hypothetical protein  35.04 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6221  hypothetical protein  35.04 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1858  hypothetical protein  35.04 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1415  small multidrug resistance protein  34.19 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303434  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1882  hypothetical protein  35.04 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226664  hitchhiker  0.00000199647 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1198  small multidrug resistance protein  36.44 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.128153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1796  hypothetical protein  34.19 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1768  hypothetical protein  34.19 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0433646  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1259  putative small multidrug resistance transmembrane protein  35.59 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627101  normal  0.60267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2846  hypothetical protein  34.48 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.367285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1802  putative small multidrug resistance transmembrane protein, DMT superfamily  33.33 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647816  hitchhiker  0.00398859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  35.92 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  30.89 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  37.66 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0927  hypothetical protein  40.85 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.110405  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4515  transporter protein  31.9 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0688727 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3978  putative small multidrug resistance transmembrane protein  36.59 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824098  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0754  small multidrug resistance protein  29.46 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0920  hypothetical protein  46.15 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176487  normal  0.189611 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1389  hypothetical protein  31.62 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2400  drug/metabolite exporter (DME) family protein  31.62 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2194  hypothetical protein  31.62 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000274513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1879  hypothetical protein  31.62 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659154  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0018  hypothetical protein  31.62 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2236  hypothetical protein  31.62 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2274  hypothetical protein  34.23 
 
 		 123 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1151  hypothetical protein  31.62 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1356  hypothetical protein  32.56 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.652272  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0921  hypothetical protein  32.73 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.729046  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  37.18 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1731  hypothetical protein  35.04 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2606  hypothetical protein  35.04 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1837  hypothetical protein  35.04 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2159  hypothetical protein  43.1 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  31.73 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  35.14 
 
 		 249 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  37.35 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  35.14 
 
 		 249 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  35.9 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4229  putative inner membrane protein  38.71 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2385  small multidrug resistance transmembrane protein  33.64 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147787 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0304  hypothetical protein  29.81 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00945381  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4064  hypothetical protein  31.93 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4020  putative inner membrane protein  32.46 
 
 		 113 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4328  hypothetical protein  31.62 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.831328  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4021  hypothetical protein  31.86 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.903985  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1323  putative small multidrug resistance transmembrane protein  33.02 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0131  hypothetical protein  31.53 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703192 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02184  hypothetical protein  40.35 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1400  small multidrug resistance protein  40.35 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  38.16 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2416  hypothetical protein  39.66 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2403  SMR family multidrug efflux pump  40.35 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.754979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2553  SMR family multidrug efflux pump  40.35 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.676636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1391  small multidrug resistance protein  40.35 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2412  SMR family multidrug efflux pump  40.35 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2634  multidrug resistance protein, SMR family  40.35 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0607087  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3399  multidrug resistance protein, SMR family  40.35 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02143  hypothetical protein  40.35 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  36.59 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5531  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  35.48 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  37.33 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2694  hypothetical protein  33.85 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0340055  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2074  small multidrug resistance protein  43.75 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2232  hypothetical protein  34.34 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.791357  normal  0.0104044 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  40.32 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  31.71 
 
 		 267 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2477  hypothetical protein  34.69 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3323  hypothetical protein  32.5 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565499  normal  0.239211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  29.11 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18320  hypothetical protein  38.46 
 
 		 115 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2160  hypothetical protein  31.9 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2487  inner membrane protein YfbW  37.04 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2542  hypothetical protein  37.04 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373163  normal  0.593435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2530  inner membrane protein YfbW  37.04 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2438  inner membrane protein YfbW  37.04 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1187  hypothetical protein  26.61 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5526  Permeases of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  25 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.625199  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1588  hypothetical protein  38 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2646  inner membrane protein YfbW  37.04 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>