236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3045 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  100 
 
 
211 aa  430  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  81.64 
 
 
213 aa  355  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  74.29 
 
 
211 aa  332  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  73.33 
 
 
211 aa  330  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  73.33 
 
 
211 aa  330  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  72.86 
 
 
211 aa  327  6e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  72.86 
 
 
211 aa  327  6e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  72.38 
 
 
211 aa  327  9e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  72.86 
 
 
211 aa  326  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  72.38 
 
 
211 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  71.43 
 
 
211 aa  325  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  73.46 
 
 
212 aa  325  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  72.38 
 
 
211 aa  323  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  51.58 
 
 
213 aa  217  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  49.22 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  50 
 
 
209 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  48.77 
 
 
211 aa  199  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  44.39 
 
 
212 aa  194  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  47.55 
 
 
213 aa  190  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  49.52 
 
 
219 aa  190  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  45.41 
 
 
207 aa  185  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  49.51 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  47.09 
 
 
216 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  42.03 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  42.51 
 
 
210 aa  171  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  44.83 
 
 
214 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  44.76 
 
 
211 aa  169  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.16 
 
 
210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  42.72 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  45.89 
 
 
206 aa  157  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  43.56 
 
 
206 aa  155  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  43.5 
 
 
218 aa  153  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  41.3 
 
 
212 aa  152  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  45.5 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  45.5 
 
 
213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  40.28 
 
 
219 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  44.19 
 
 
214 aa  142  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  43.9 
 
 
233 aa  141  6e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  38.54 
 
 
215 aa  137  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  40.69 
 
 
233 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  39.17 
 
 
232 aa  136  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1211  protein of unknown function UPF0029  41.38 
 
 
212 aa  135  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  35.18 
 
 
212 aa  134  8e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  44.27 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  42.5 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  49.66 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0196  elongation factor  39.44 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  44.79 
 
 
217 aa  132  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  38.89 
 
 
206 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.74 
 
 
208 aa  128  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  36.5 
 
 
203 aa  128  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  36.73 
 
 
203 aa  127  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  39.09 
 
 
205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  42.44 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  36.36 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  35.6 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  35.75 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  35.42 
 
 
196 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  35.79 
 
 
200 aa  124  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  40.78 
 
 
206 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  36.26 
 
 
199 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  34.45 
 
 
210 aa  123  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  37.76 
 
 
205 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  42.17 
 
 
192 aa  122  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  37.37 
 
 
198 aa  122  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  32.26 
 
 
216 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3669  protein of unknown function UPF0029  40.11 
 
 
192 aa  122  4e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253627  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  36.46 
 
 
207 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0533  hypothetical protein  37.44 
 
 
205 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.00814053  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2511  hypothetical protein  34.07 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  39.04 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  34.74 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  42.6 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  36.87 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  45.45 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  34.65 
 
 
213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  35.96 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1598  hypothetical protein  42.57 
 
 
205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00000000468439  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  39.62 
 
 
204 aa  119  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  33.5 
 
 
204 aa  119  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  36.5 
 
 
245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  34.21 
 
 
197 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  36.27 
 
 
194 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  44.16 
 
 
204 aa  118  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  35.92 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  36.46 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  36.13 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  43.2 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  33.7 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  36.36 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  38.99 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4011  hypothetical protein  33.33 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.798676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  37.16 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  34.36 
 
 
290 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  36.41 
 
 
195 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  36.9 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  36.9 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  36.9 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  35.75 
 
 
194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  36.36 
 
 
195 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>