267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2939 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2939  Proline dehydrogenase  100 
 
 
305 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3090  Proline dehydrogenase  93.44 
 
 
305 aa  591  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3600  proline dehydrogenase  82.3 
 
 
305 aa  525  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5148  proline dehydrogenase family protein  80.98 
 
 
305 aa  518  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4721  proline dehydrogenase  80.98 
 
 
305 aa  518  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4736  proline dehydrogenase  80.98 
 
 
305 aa  518  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5159  proline dehydrogenase family protein  80.98 
 
 
305 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5121  proline dehydrogenase family protein  80.98 
 
 
305 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4879  proline dehydrogenase family protein  80.33 
 
 
305 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5153  proline dehydrogenase family protein  80.66 
 
 
305 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5253  proline dehydrogenase family protein  80.33 
 
 
305 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0498834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0091  proline dehydrogenase family protein  80.33 
 
 
305 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4838  proline dehydrogenase  79.34 
 
 
305 aa  512  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2524  Proline dehydrogenase  54.25 
 
 
307 aa  361  7.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.30854  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0599  Proline dehydrogenase  45.21 
 
 
306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1324  proline dehydrogenase  46.51 
 
 
333 aa  265  8e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.26467  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1854  proline dehydrogenase  44.82 
 
 
333 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1819  proline dehydrogenase  44.82 
 
 
333 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2640  Proline dehydrogenase  43.56 
 
 
307 aa  263  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0662  Proline dehydrogenase  41.83 
 
 
331 aa  263  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0851  proline dehydrogenase  42.39 
 
 
310 aa  257  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.435625  normal  0.094276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1338  L-proline dehydrogenase  43.93 
 
 
306 aa  252  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0183  Proline dehydrogenase  44.13 
 
 
290 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3124  Proline dehydrogenase  42.28 
 
 
307 aa  243  3e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.206513  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4483  Proline dehydrogenase  40.53 
 
 
306 aa  229  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1511  proline dehydrogenase  37.75 
 
 
302 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3097  proline dehydrogenase  41.01 
 
 
308 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.274193 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0248  L-proline dehydrogenase  37.97 
 
 
317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529478  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02730  L-proline dehydrogenase  37.66 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.655288  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0480  L-proline dehydrogenase  39.36 
 
 
316 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4255  L-proline dehydrogenase  36.01 
 
 
318 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4025  L-proline dehydrogenase  36.01 
 
 
318 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4100  L-proline dehydrogenase  36.01 
 
 
318 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422146  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4460  Proline dehydrogenase  36.96 
 
 
306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24480  L-proline dehydrogenase  38.22 
 
 
319 aa  211  9e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0434  L-proline dehydrogenase  39.49 
 
 
311 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0201  Proline dehydrogenase  36.83 
 
 
317 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0078  Proline dehydrogenase  37.01 
 
 
308 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1424  Proline dehydrogenase  38.99 
 
 
311 aa  209  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0568562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0409  proline dehydrogenase  39.27 
 
 
306 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00302013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1081  Proline dehydrogenase  41.09 
 
 
307 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.962352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0088  L-proline dehydrogenase  40.36 
 
 
308 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0342  proline dehydrogenase  37.04 
 
 
305 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0992788  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4525  proline dehydrogenase  35.37 
 
 
320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324934  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5760  Proline dehydrogenase  34.77 
 
 
306 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2923  L-proline dehydrogenase  35.84 
 
 
306 aa  198  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8354  Proline dehydrogenase  35.83 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11212  proline dehydrogenase  34.3 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0207588  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0646  Proline dehydrogenase  38.49 
 
 
308 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1295  Proline dehydrogenase  39.86 
 
 
317 aa  195  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1107  Proline dehydrogenase  38.41 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.000219006  normal  0.0483795 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1500  L-proline dehydrogenase  35.14 
 
 
306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49139  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0949  Proline dehydrogenase  36.18 
 
 
295 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0346  proline dehydrogenase  33.83 
 
 
318 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.417715  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4054  Proline dehydrogenase  34.66 
 
 
279 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0351  Proline dehydrogenase  34.91 
 
 
279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0346031  normal  0.177758 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1150  Proline dehydrogenase  37.19 
 
 
290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.906847  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2929  Proline dehydrogenase  34.66 
 
 
278 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0496  Proline dehydrogenase  35.4 
 
 
279 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2823  L-proline dehydrogenase  33.45 
 
 
309 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5008  proline dehydrogenase  33.47 
 
 
271 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1366  proline dehydrogenase superfamily protein  31.65 
 
 
321 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2465  proline dehydrogenase  30.32 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3446  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  32.81 
 
 
993 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0833  aldehyde dehydrogenase  30.67 
 
 
996 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.286586  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3332  proline dehydrogenase  28.42 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254194  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2942  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.28 
 
 
993 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1002  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  30.28 
 
 
991 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0261182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0117  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.02 
 
 
991 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0114  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.02 
 
 
991 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.951346  normal  0.654894 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3512  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.88 
 
 
1003 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3142  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.34 
 
 
990 aa  115  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1959  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.16 
 
 
1001 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3395  proline dehydrogenase/delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.38 
 
 
1004 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6745  Proline dehydrogenase  26.43 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.989214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1806  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.12 
 
 
1004 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2411  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.99 
 
 
1004 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0350749  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3209  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.8 
 
 
1001 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0054  L-proline dehydrogenase / delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.36 
 
 
1003 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0070  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  29.06 
 
 
1006 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2146  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28 
 
 
1013 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1378  Aldehyde Dehydrogenase  28.62 
 
 
975 aa  97.8  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0715  aldehyde dehydrogenase  27.25 
 
 
1028 aa  97.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1871  putative delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.88 
 
 
1002 aa  95.5  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00392052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2369  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 
1323 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.557702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2268  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 
1323 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2037  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 
1323 aa  90.1  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.851494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2311  bifunctional proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.12 
 
 
1221 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2420  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase / L-proline dehydrogenase  26.43 
 
 
1191 aa  87.4  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.340967  normal  0.812309 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01017  fused DNA-binding transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 
1320 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1427  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.43 
 
 
1240 aa  86.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2111  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 
1320 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.384648  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2581  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 
1320 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0830749 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01024  hypothetical protein  28.35 
 
 
1320 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1129  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 
1320 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.99011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2628  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 
1320 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1251  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 
1320 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.63555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1132  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 
1320 aa  85.9  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.585583  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2304  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  28.35 
 
 
1320 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0521  trifunctional transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  27.9 
 
 
1317 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0520721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>