290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2848 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
300 aa  589  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  67 
 
 
302 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  51.38 
 
 
294 aa  256  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  49.65 
 
 
296 aa  255  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  50.69 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  50.69 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  49.32 
 
 
295 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  50.35 
 
 
294 aa  252  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  50.35 
 
 
294 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  50.68 
 
 
295 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  49.49 
 
 
295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  49.64 
 
 
310 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  47.01 
 
 
308 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  41.94 
 
 
303 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.45 
 
 
302 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  41.22 
 
 
303 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  41.58 
 
 
309 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  41.58 
 
 
303 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  41.22 
 
 
303 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  41.22 
 
 
303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  41.22 
 
 
303 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  41.22 
 
 
303 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  42.42 
 
 
302 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.82 
 
 
298 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  41.22 
 
 
303 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  41.58 
 
 
303 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  40.62 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.37 
 
 
295 aa  212  5.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  42.5 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  44.12 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.86 
 
 
302 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.44 
 
 
293 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.62 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.28 
 
 
316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.99 
 
 
307 aa  169  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.26 
 
 
300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  34.48 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.03 
 
 
305 aa  158  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  37.24 
 
 
295 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  31.69 
 
 
297 aa  155  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  30.99 
 
 
297 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  36.82 
 
 
316 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  31.82 
 
 
300 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.25 
 
 
307 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.97 
 
 
295 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  32.01 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.11 
 
 
300 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.11 
 
 
300 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.38 
 
 
304 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
290 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.89 
 
 
286 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  28.73 
 
 
296 aa  112  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  35.84 
 
 
318 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  30 
 
 
285 aa  109  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  34.18 
 
 
277 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.32 
 
 
305 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  30.35 
 
 
283 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  28.16 
 
 
273 aa  99.8  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.83 
 
 
317 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  31.56 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  30.03 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  32.03 
 
 
306 aa  89.7  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  30.94 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  26.45 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  29.05 
 
 
304 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  24.82 
 
 
294 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  32.37 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  32.18 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.5 
 
 
325 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0281  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.26 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.68 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.07 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 
314 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0737  hypothetical protein  26.45 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0689  hypothetical protein  26.45 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.164127  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  29.47 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  26.96 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0755616 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  26.81 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  27.24 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  30.15 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  28.77 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3346  hypothetical protein  25.63 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.4 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.36 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0438  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 
316 aa  63.9  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0563  hypothetical protein  26.45 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1306  DMT family permease  25.83 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.602265  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0654  DMT family permease  26.07 
 
 
303 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  29.6 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2307  hypothetical protein  26.07 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  0.119716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  24.91 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  24.25 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  28.77 
 
 
314 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  24 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2448  hypothetical protein  22.03 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>