226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2754 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 184 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  61.41 
 
 		 192 aa  236  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  42.2 
 
 		 181 aa  155  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  40.78 
 
 		 181 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  41.9 
 
 		 181 aa  154  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  42.46 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  41.9 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  41.9 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  41.9 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  41.9 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  41.34 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  41.34 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  43.86 
 
 		 184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  36.53 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  36.47 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  29.69 
 
 		 190 aa  84.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  27.07 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  30.91 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  29.59 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  33.53 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  34.38 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  34.38 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  31.33 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  30.49 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  28.07 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  38.38 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  30.99 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  27.81 
 
 		 193 aa  77.4  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  29.26 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  28.73 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  27.91 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  28.43 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  33.83 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  30.25 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  30.43 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  30.47 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  33.59 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  33.08 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  29.63 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  28.22 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  29.17 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  28.46 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  27.13 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  29.35 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  29.94 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  31.58 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  25.15 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  31.15 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  26.99 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  30.47 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  30.47 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  36.89 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  29.27 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  30.46 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  37.37 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  30.63 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 179 aa  70.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  28.8 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  28.97 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  29.69 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  32.85 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  32.85 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  31.25 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  29.35 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  35.92 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  30.57 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  29.92 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  32.11 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  25.95 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  27.1 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  31.43 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  27.87 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  29.61 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  27.84 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3075  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  32.03 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  31.3 
 
 		 188 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  29.23 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0869  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  25.6 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  30.53 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  29.12 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  28.12 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  31.39 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  23.96 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  23.63 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  32.71 
 
 		 271 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7219  2'-5' RNA ligase  33.63 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  30.23 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  28 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>