More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2716 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2172  acetyl-CoA synthetase, putative  58.87 
 
 
531 aa  665    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4781  acetyl-CoA synthetase, putative  72.69 
 
 
522 aa  804    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4543  acetyl-CoA synthetase  72.24 
 
 
528 aa  810    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4379  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  72.24 
 
 
528 aa  810    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4389  acetate--CoA ligase (acetyl-Co A synthetase)  72.05 
 
 
528 aa  810    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2716  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
530 aa  1095    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  73.95 
 
 
528 aa  821    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4896  acetyl-CoA synthetase  72.31 
 
 
522 aa  801    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0723  AMP-dependent synthetase and ligase  83.11 
 
 
530 aa  924    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2685  AMP-dependent synthetase and ligase  61.89 
 
 
539 aa  691    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4780  putative acetyl-CoA synthetase  72.43 
 
 
528 aa  811    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4476  AMP-dependent synthetase and ligase  71.48 
 
 
528 aa  804    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4763  putative acetyl-CoA synthetase  72.24 
 
 
528 aa  810    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2631  AMP-dependent synthetase and ligase  61.89 
 
 
539 aa  691    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0481  putative acetyl-CoA synthetase  72.05 
 
 
528 aa  804    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4754  putative acetyl-CoA synthetase  72.05 
 
 
528 aa  810    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  55.62 
 
 
548 aa  593  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  46.67 
 
 
537 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4369  AMP-dependent synthetase and ligase  45.42 
 
 
542 aa  431  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1682  AMP-dependent synthetase and ligase  43.31 
 
 
609 aa  420  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0592  AMP-dependent synthetase and ligase  42.29 
 
 
555 aa  398  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.132883 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0551  AMP-dependent synthetase and ligase  42.03 
 
 
554 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0114354  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  41.51 
 
 
555 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.89042  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  41.01 
 
 
566 aa  389  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  42.48 
 
 
567 aa  390  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0844  hypothetical protein  40.98 
 
 
586 aa  390  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.765159  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  41.39 
 
 
552 aa  386  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1835  AMP-dependent synthetase and ligase  41.85 
 
 
571 aa  385  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0537163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1256  hypothetical protein  40.71 
 
 
563 aa  384  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.956309  normal  0.567013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4371  AMP-dependent synthetase and ligase  42.31 
 
 
528 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2172  AMP-binding protein  39.47 
 
 
559 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  40.67 
 
 
559 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  40.49 
 
 
616 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.971604 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1469  AMP-dependent synthetase and ligase  39.7 
 
 
559 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447504  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0520  AMP-dependent synthetase and ligase  40.57 
 
 
559 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 
627 aa  374  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0317  AMP-dependent synthetase and ligase  40.41 
 
 
559 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 
552 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0818  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 
549 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0993  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 
551 aa  360  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.058663  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1242  acetyl-CoA synthetase  37.71 
 
 
557 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 
552 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000941409  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17560  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  36.45 
 
 
589 aa  355  1e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.208235  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 
552 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 
593 aa  353  2.9999999999999997e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1701  AMP-dependent synthetase and ligase  39.44 
 
 
557 aa  352  1e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.902342  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0040  AMP-binding protein  39.32 
 
 
550 aa  349  8e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0957157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17330  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  38.36 
 
 
582 aa  348  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.296873  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0003  AMP-dependent synthetase and ligase  38.16 
 
 
557 aa  348  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  37.88 
 
 
546 aa  346  5e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  38.63 
 
 
534 aa  346  5e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00970947  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07940  acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligase  35.27 
 
 
594 aa  346  7e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.190116 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2317  AMP-binding protein  40.28 
 
 
549 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975464  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0011  AMP-dependent synthetase and ligase  38.84 
 
 
560 aa  339  7e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2619  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 
568 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.987136  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2586  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 
566 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.151835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4442  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 
525 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0647357  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2705  AMP-dependent synthetase and ligase  38.08 
 
 
568 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4255  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 
565 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2800  AMP-dependent synthetase and ligase  37.88 
 
 
568 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4143  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 
565 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1162  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 
563 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.354451  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3170  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 
567 aa  326  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1141  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 
522 aa  322  7e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.41787  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05310  acetyl-coenzyme A synthetase  37.15 
 
 
562 aa  322  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.366721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0343  putative acetyl-coenzyme A synthetase  37.9 
 
 
571 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.624222  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3582  putative acetyl-CoA synthetase  37.65 
 
 
576 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.235263 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0406  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 
564 aa  321  3e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1061  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 
595 aa  320  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652344  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5324  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 
568 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00235844  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3405  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 
568 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.116321  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4962  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 
568 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.441229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0715  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 
609 aa  316  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0701  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 
576 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4225  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 
508 aa  313  5.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217524  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_003296  RS05571  acetyl-coenzyme A synthetase  36.05 
 
 
567 aa  312  9e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537353  normal  0.230746 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 
576 aa  311  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4903  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 
568 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.0797319 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3298  AMP-dependent synthetase and ligase  38.38 
 
 
573 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373155  normal  0.115913 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4384  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 
568 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6529  normal  0.0709193 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3974  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 
564 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136654  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4087  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 
564 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201784  normal  0.138033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 
573 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3573  putative AMP-binding protein  36.02 
 
 
574 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2729  acetyl-CoA synthetase  36.86 
 
 
571 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0445  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
562 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0711  acetyl-CoA synthetase  36.48 
 
 
571 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2123  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 
572 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.500205  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1788  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.373968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1823  acetyl-CoA synthetase  36.35 
 
 
568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000207861  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1201  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 
539 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.683359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 
555 aa  304  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.805584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3090  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 
576 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.145452 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1226  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 
539 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 
573 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.123922  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 
535 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1158  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 
544 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187529  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 
568 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2179  AMP-binding enzyme  35.14 
 
 
567 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0827  AMP-binding enzyme  35.14 
 
 
567 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>