More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2629 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.85 
 
 
563 aa  759  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  64.16 
 
 
561 aa  765  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.8 
 
 
563 aa  759  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.98 
 
 
582 aa  764  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.62 
 
 
563 aa  759  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.98 
 
 
561 aa  763  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
557 aa  1151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  64.21 
 
 
561 aa  764  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.85 
 
 
563 aa  759  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.85 
 
 
582 aa  759  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  79.32 
 
 
566 aa  944  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.85 
 
 
561 aa  761  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  63.82 
 
 
561 aa  759  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  58.62 
 
 
549 aa  657  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  52.93 
 
 
569 aa  605  1e-172  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  51.26 
 
 
551 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  1.91926e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  51.34 
 
 
559 aa  573  1e-162  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  51.7 
 
 
561 aa  571  1e-161  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  50.26 
 
 
577 aa  563  1e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  7.03503e-06 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  49.21 
 
 
591 aa  565  1e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  49.65 
 
 
590 aa  565  1e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  52.15 
 
 
539 aa  563  1e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  50.9 
 
 
565 aa  551  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  48.39 
 
 
564 aa  535  1e-150  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.99 
 
 
585 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  47.31 
 
 
584 aa  525  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  44.96 
 
 
558 aa  513  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  47.55 
 
 
578 aa  510  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  46.44 
 
 
583 aa  508  1e-142  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  47.83 
 
 
543 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  46.22 
 
 
573 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 
584 aa  493  1e-138  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  44.6 
 
 
585 aa  492  1e-138  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  45.65 
 
 
575 aa  495  1e-138  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  45.59 
 
 
564 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  43.86 
 
 
560 aa  483  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  44.76 
 
 
583 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  44.32 
 
 
554 aa  466  1e-130  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  42.14 
 
 
567 aa  460  1e-128  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  42.24 
 
 
577 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  43.19 
 
 
571 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  40.88 
 
 
564 aa  439  1e-122  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2588  AMP-dependent synthetase and ligase  42.47 
 
 
591 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.401336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  42.12 
 
 
549 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  42.3 
 
 
549 aa  433  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  41.62 
 
 
577 aa  431  1e-119  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  42.35 
 
 
568 aa  430  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  42.33 
 
 
577 aa  431  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  42.81 
 
 
561 aa  425  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  40.6 
 
 
579 aa  416  1e-115  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2064  long-chain fatty-acid-CoA ligase  41.73 
 
 
560 aa  417  1e-115  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 
566 aa  416  1e-115  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.909575  hitchhiker  0.000208439 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.17 
 
 
562 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  2.77435e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.62 
 
 
561 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  40.85 
 
 
544 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.17 
 
 
562 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  41.84 
 
 
569 aa  413  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1993  AMP-dependent synthetase and ligase  42.45 
 
 
567 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.37 
 
 
562 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.99 
 
 
572 aa  410  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.45 
 
 
561 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.27 
 
 
561 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.27 
 
 
561 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  41.27 
 
 
561 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.99 
 
 
577 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  5.65226e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.27 
 
 
561 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  41.27 
 
 
561 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.36 
 
 
568 aa  406  1e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.48 
 
 
569 aa  406  1e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4353  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.6 
 
 
565 aa  407  1e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.09 
 
 
583 aa  408  1e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.18 
 
 
573 aa  405  1e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  4.11499e-05  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  41.09 
 
 
583 aa  408  1e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.93 
 
 
565 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  40.32 
 
 
601 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  40.64 
 
 
561 aa  405  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40 
 
 
565 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.6 
 
 
572 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.99 
 
 
557 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.99 
 
 
557 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  41.03 
 
 
560 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.97 
 
 
572 aa  405  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.02 
 
 
561 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.02 
 
 
561 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.12 
 
 
557 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.02 
 
 
561 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.02 
 
 
561 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.02 
 
 
561 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.24 
 
 
557 aa  399  1e-110  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.65 
 
 
565 aa  401  1e-110  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.64 
 
 
557 aa  399  1e-110  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 
599 aa  400  1e-110  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4097  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.71 
 
 
563 aa  402  1e-110  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  39.93 
 
 
559 aa  400  1e-110  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.79 
 
 
562 aa  401  1e-110  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3834  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.64 
 
 
563 aa  399  1e-110  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.79 
 
 
562 aa  400  1e-110  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.65 
 
 
565 aa  401  1e-110  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.06 
 
 
557 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2778  putative long chain fatty-acid CoA ligase(long- chain acyl-CoA synthetase)  39.79 
 
 
604 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422591  normal  0.203216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>