More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2535 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  100 
 
 
282 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0914  prephenate dehydratase  78.65 
 
 
282 aa  434  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4552  prephenate dehydratase  61.79 
 
 
283 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0682  prephenate dehydratase  61.79 
 
 
283 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000690128  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4280  prephenate dehydratase  61.43 
 
 
283 aa  341  8e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4331  prephenate dehydratase  61.43 
 
 
283 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.662649  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4666  prephenate dehydratase  61.43 
 
 
283 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4525  prephenate dehydratase  61.07 
 
 
283 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.802903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4168  prephenate dehydratase  61.07 
 
 
283 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4514  prephenate dehydratase  61.07 
 
 
283 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.682816 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4179  prephenate dehydratase  61.07 
 
 
283 aa  338  4e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.409752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4567  prephenate dehydratase  60.71 
 
 
283 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3149  prephenate dehydratase  61.07 
 
 
283 aa  334  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.286294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  39.5 
 
 
276 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  39.93 
 
 
272 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1905  prephenate dehydratase  40.21 
 
 
279 aa  202  7e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0697  prephenate dehydratase  41.49 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  39.86 
 
 
315 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  35.21 
 
 
277 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  35.21 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  35.21 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  37.06 
 
 
303 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  38.11 
 
 
286 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  37.15 
 
 
284 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  34.88 
 
 
311 aa  180  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  36.62 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  36.75 
 
 
372 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0097  Prephenate dehydratase  38.57 
 
 
314 aa  178  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0315701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  39.29 
 
 
305 aa  178  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  37.1 
 
 
373 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0282  Prephenate dehydratase  38.13 
 
 
326 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.209842 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  36.49 
 
 
278 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  38.49 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2105  prephenate dehydratase  36.2 
 
 
318 aa  171  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.547731 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  37.37 
 
 
315 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  38.85 
 
 
324 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  38.21 
 
 
386 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  36.04 
 
 
279 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  35.34 
 
 
283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  36.4 
 
 
274 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1274  Prephenate dehydratase  35.21 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.143438  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0138  prephenate dehydratase  35.84 
 
 
327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  35.86 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  35.23 
 
 
311 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  36.27 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6401  Prephenate dehydratase  37.41 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  35.34 
 
 
279 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.04 
 
 
364 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  36.04 
 
 
364 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  34.98 
 
 
355 aa  162  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  35.69 
 
 
365 aa  162  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  36.2 
 
 
359 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  36.92 
 
 
275 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  36.04 
 
 
364 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  35.34 
 
 
364 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  34.88 
 
 
277 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  35.97 
 
 
280 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0480  prephenate dehydratase  34.24 
 
 
296 aa  159  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0463972  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  35.23 
 
 
280 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  36.2 
 
 
359 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  35.69 
 
 
367 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  37.28 
 
 
356 aa  157  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  35.69 
 
 
364 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.43 
 
 
368 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  36.4 
 
 
371 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  35.34 
 
 
364 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  35.34 
 
 
365 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  35.69 
 
 
364 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  35 
 
 
359 aa  156  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01130  prephenate dehydratase  34.41 
 
 
316 aa  156  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  38.21 
 
 
358 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  33.33 
 
 
286 aa  155  6e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  34.98 
 
 
365 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1594  prephenate dehydratase  36.07 
 
 
317 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0572712  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  33.93 
 
 
371 aa  153  4e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  33.8 
 
 
293 aa  153  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  32.66 
 
 
413 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  34.63 
 
 
402 aa  152  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3428  prephenate dehydratase  34.98 
 
 
284 aa  151  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  35.38 
 
 
306 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0841  prephenate dehydratase  34.31 
 
 
268 aa  151  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.14 
 
 
371 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  31.79 
 
 
371 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  31.79 
 
 
371 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  38.71 
 
 
358 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1293  Prephenate dehydratase  34.29 
 
 
293 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.821795  normal  0.378721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  32.01 
 
 
355 aa  150  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  37.63 
 
 
358 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  37.28 
 
 
359 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  35.34 
 
 
399 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2043  prephenate dehydratase  35.02 
 
 
283 aa  148  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.64689  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2858  chorismate mutase  35.79 
 
 
373 aa  148  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.42066  hitchhiker  0.0000000270068 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  33.57 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  35.48 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  32.01 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4083  prephenate dehydratase  34.52 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0689378  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.93 
 
 
387 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4403  prephenate dehydratase  34.88 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0810  prephenate dehydratase  34.17 
 
 
278 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000733608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1284  prephenate dehydratase  32.75 
 
 
295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000630901  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>