More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2517 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
91 aa  184  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  87.64 
 
 
90 aa  166  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  62.35 
 
 
86 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  62.35 
 
 
86 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  62.35 
 
 
86 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  62.35 
 
 
86 aa  116  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  61.18 
 
 
86 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  61.18 
 
 
86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  61.18 
 
 
86 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  61.18 
 
 
86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  60 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  58.82 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  61.18 
 
 
86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  51.19 
 
 
118 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  44.94 
 
 
137 aa  91.3  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 
117 aa  90.5  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  44.58 
 
 
102 aa  88.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  42.68 
 
 
118 aa  87.4  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  40.24 
 
 
118 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 
143 aa  84  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  47.44 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  41.77 
 
 
118 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  48.72 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  44.32 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  39.24 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  45.57 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  44.32 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  40.26 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  37.35 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  38.55 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  38.27 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  41.77 
 
 
101 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  41.77 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  41.77 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  37.78 
 
 
95 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  37.35 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 
86 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 
86 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  43.21 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1790  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000167941  hitchhiker  0.00454541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  48.65 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1202  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 
86 aa  73.9  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.36693  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  37.63 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  46.84 
 
 
110 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 
113 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  36.14 
 
 
109 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  38.27 
 
 
109 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 
106 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  36.26 
 
 
92 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12913  preprotein translocase, YajC subunit  40.91 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168019  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  36.14 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  39.08 
 
 
91 aa  70.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  34.52 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  35.96 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  35.96 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  36.14 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  40.23 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  38.89 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  35.8 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  41.89 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  41.46 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  35.48 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  42.11 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  40 
 
 
105 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  35.16 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  41.46 
 
 
111 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  34.52 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  34.52 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  45.95 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  36.14 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  40.45 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  40.51 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  38.82 
 
 
108 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  49.32 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  41.57 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  40.48 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>