More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2506 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1396  aspartyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 
597 aa  650    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000259545  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01727  aspartyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 
586 aa  640    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
600 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  64.54 
 
 
600 aa  790    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 
594 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
590 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  54.25 
 
 
590 aa  643    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  61.21 
 
 
585 aa  757    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  65.02 
 
 
588 aa  802    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 
599 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 
605 aa  657    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  77.19 
 
 
591 aa  951    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
590 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 
600 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2107  aspartyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 
583 aa  724    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.863952  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2433  aspartyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 
591 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  77.36 
 
 
591 aa  953    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  76.62 
 
 
591 aa  950    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  76.79 
 
 
591 aa  952    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  76.84 
 
 
591 aa  948    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
600 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 
593 aa  643    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 
593 aa  644    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
590 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 
597 aa  719    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 
599 aa  652    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 
600 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0724  aspartyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 
600 aa  687    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000988367  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
602 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 
597 aa  656    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0247  aspartyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 
614 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359084  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 
598 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  53.06 
 
 
595 aa  646    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
590 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  58 
 
 
596 aa  708    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
600 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 
596 aa  637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  55.52 
 
 
595 aa  652    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 
594 aa  709    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  58.14 
 
 
606 aa  708    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 
601 aa  698    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  76.62 
 
 
591 aa  950    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  65.02 
 
 
588 aa  806    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
600 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1313  aspartyl-tRNA synthetase  55.93 
 
 
599 aa  675    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
588 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  61.05 
 
 
600 aa  742    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 
600 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  59.52 
 
 
595 aa  744    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  76.78 
 
 
591 aa  940    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 
600 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 
594 aa  657    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  54.61 
 
 
594 aa  669    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  77.99 
 
 
589 aa  963    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
599 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 
599 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 
614 aa  684    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
598 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0378  aspartyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
602 aa  648    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
598 aa  635    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  65.02 
 
 
588 aa  806    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 
592 aa  749    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5000  aspartyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 
618 aa  651    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
600 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 
593 aa  717    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2948  aspartyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 
592 aa  638    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 
598 aa  723    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2188  aspartyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
597 aa  734    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1899  aspartyl-tRNA synthetase  58.35 
 
 
597 aa  734    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 
599 aa  637    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  57.69 
 
 
595 aa  692    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 
592 aa  642    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  54.44 
 
 
599 aa  657    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2665  aspartyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 
592 aa  686    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.72931  hitchhiker  0.00000366729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 
589 aa  651    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  61.51 
 
 
586 aa  754    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 
600 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 
589 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2226  aspartyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 
590 aa  674    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0590  aspartyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 
591 aa  699    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0860  aspartyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
617 aa  680    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1309  aspartyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 
591 aa  665    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1948  aspartyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 
583 aa  719    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 
591 aa  635    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000382007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  77.02 
 
 
591 aa  950    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 
613 aa  706    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
600 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
607 aa  650    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 
598 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 
600 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  55.33 
 
 
623 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  57.07 
 
 
594 aa  708    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
598 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 
596 aa  637    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 
617 aa  673    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 
590 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  58.65 
 
 
598 aa  718    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
599 aa  639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  56.57 
 
 
610 aa  678    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  58.1 
 
 
593 aa  701    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>