More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2471 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  90.68 
 
 		 245 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  79.4 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  79.74 
 
 		 265 aa  387  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  79.4 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  79.4 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  79.4 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  79.4 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  79.4 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  79.4 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  79.4 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  79.65 
 
 		 237 aa  384  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  62.28 
 
 		 234 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  64.59 
 
 		 226 aa  278  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  57.59 
 
 		 239 aa  275  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  59.91 
 
 		 244 aa  268  5e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  58.33 
 
 		 256 aa  265  5e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  57.08 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  59.29 
 
 		 236 aa  249  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  55.56 
 
 		 231 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  79.43 
 
 		 149 aa  241  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  56.64 
 
 		 232 aa  240  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  53.15 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  53.15 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  56.25 
 
 		 207 aa  214  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  54.76 
 
 		 219 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  51.98 
 
 		 239 aa  208  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  51.49 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  51.49 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  51.49 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  51.49 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  51.49 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  51.49 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  51.49 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  51.49 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  51.49 
 
 		 239 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  49.52 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  50 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  50.5 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  50.5 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  51.96 
 
 		 241 aa  201  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  49.07 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  47.32 
 
 		 245 aa  195  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  49.51 
 
 		 241 aa  194  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  48.7 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  48.04 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  48.04 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  49.05 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  48.86 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  48.37 
 
 		 243 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  49.03 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  47.85 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  46.08 
 
 		 241 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  47.57 
 
 		 242 aa  185  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  48.18 
 
 		 244 aa  181  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  40.79 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  45.59 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  64.6 
 
 		 114 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  64.66 
 
 		 118 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4361  RNA polymerase sigma-K factor  79.17 
 
 		 100 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  62.73 
 
 		 126 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  55.36 
 
 		 118 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  50 
 
 		 113 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2870  sporulation sigma factor SigG  31.08 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000515832  hitchhiker  0.0000000000171975 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1203  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  32.06 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000512753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  32.79 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1425  sporulation sigma factor SigG  31.97 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00153435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2066  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  32.67 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000506599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1861  RNA polymerase sigma factor RpoS  30.62 
 
 		 352 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0331  RNA polymerase sigma factor  30.62 
 
 		 352 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  33.92 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1552  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  31.15 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  32.67 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  33.33 
 
 		 249 aa  96.7  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0930  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.91 
 
 		 332 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0687  sporulation sigma factor SigG  32.16 
 
 		 257 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1436  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  29.34 
 
 		 344 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121871  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0937  RNA polymerase sigma-70 factor family protein  29.39 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  33.33 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07020  sporulation sigma factor SigF  30.33 
 
 		 257 aa  95.5  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1224  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  32.22 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0121865  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  31.8 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1031  sporulation sigma factor SigG  32.13 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000174079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  32.13 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2115  RNA polymerase sigma factor RpoS  30.16 
 
 		 386 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213085  normal  0.555888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1008  RNA polymerase, sigma 28 subunit  29.05 
 
 		 289 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000100967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  33.91 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  30.49 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2095  RNA polymerase sigma factor RpoS  30.16 
 
 		 391 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0478  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  34.62 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  29.88 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3342  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.91 
 
 		 322 aa  92.4  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.101192  unclonable  0.0000000171583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1291  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigG  27.78 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1407  RNA polymerase sigma factor  27.1 
 
 		 438 aa  91.7  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.723356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3730  sporulation sigma factor SigG  32.38 
 
 		 292 aa  92  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1702  RpoS  28.57 
 
 		 303 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0629652  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1231  RNA polymerase, sigma 28 subunit  28.91 
 
 		 294 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.927052  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  30.49 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  30.49 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1213  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.68 
 
 		 324 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>