217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2419 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 263 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  77.73 
 
 		 262 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  58.7 
 
 		 248 aa  317  7.999999999999999e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  57.89 
 
 		 248 aa  316  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  58.3 
 
 		 248 aa  315  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  58.3 
 
 		 248 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  58.7 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  58.7 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  58.7 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  58.7 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  58.7 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  58.7 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  56.68 
 
 		 248 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1133  RecO family DNA repair protein  30.4 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.519914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  33.62 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0990  DNA replication and repair protein RecO  30.71 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000715553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  33.05 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  30.33 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0047  DNA repair protein RecO  32.91 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  29.15 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0046  DNA repair protein RecO  33.33 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0739  DNA replication and repair protein RecO  29.63 
 
 		 261 aa  128  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  30.28 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0020  DNA repair protein RecO  32.65 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.144319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  29.29 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  30.83 
 
 		 258 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  29.77 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1624  DNA repair protein RecO  26.94 
 
 		 248 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1658  DNA repair protein RecO  26.94 
 
 		 248 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0781  DNA replication and repair protein RecO  31.82 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.672101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  27.69 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  29.03 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  30.7 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  31.28 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  30.22 
 
 		 249 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  28.33 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  28 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  26.22 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0647  DNA repair protein RecO  30.67 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  26.75 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  29.75 
 
 		 243 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  26.78 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  25.83 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  30 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  29.55 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  29.55 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  26.73 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  25.11 
 
 		 244 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1638  DNA repair protein RecO  24.79 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  30.48 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  29.76 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  26.27 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  26.27 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  26.61 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  28.74 
 
 		 254 aa  89.4  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  27.24 
 
 		 262 aa  89  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  25.69 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  27.98 
 
 		 217 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  27.08 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  24.38 
 
 		 246 aa  85.9  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  28.25 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0118  DNA repair protein RecO  30.22 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.522104  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13640  DNA repair protein RecO  29.89 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.461135  normal  0.670097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  30 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  30.98 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  28.11 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  30.81 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  30.3 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2271  DNA repair protein RecO  29.35 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1986  DNA repair protein RecO  29.35 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  25.51 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2177  DNA repair protein RecO  27.62 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11770  DNA repair protein RecO  24.39 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0355162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1255  DNA repair protein RecO  26.77 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.361247  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  29.55 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  25.13 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  27.57 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  28.21 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  28 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  27 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  28.27 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0795  DNA repair protein RecO  23.85 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0913836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  28.25 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  27.57 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  30.11 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2040  DNA repair protein RecO  27.09 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.086646  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07620  DNA repair protein RecO  22.95 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.572835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12388  DNA repair protein RecO  27.66 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0535706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1766  DNA repair protein RecO  29.89 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  29.11 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3450  DNA repair protein RecO  26.14 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156486  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3513  DNA repair protein RecO  26.14 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.834476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3461  DNA repair protein RecO  26.14 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660953  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2713  DNA repair protein RecO  26.7 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825207 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  27.78 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3823  DNA repair protein RecO  25.82 
 
 		 284 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0140866  normal  0.769517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  29.28 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  29.38 
 
 		 245 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  28.09 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>