More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2415 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  100 
 
 
601 aa  1244    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  71.43 
 
 
598 aa  887    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  51.82 
 
 
598 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  51.65 
 
 
598 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  51.65 
 
 
598 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  51.65 
 
 
598 aa  600  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  51.65 
 
 
598 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  51.65 
 
 
598 aa  600  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  51.65 
 
 
598 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  51.82 
 
 
598 aa  601  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  52.17 
 
 
571 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  52.53 
 
 
598 aa  595  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  51.81 
 
 
600 aa  597  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  38.68 
 
 
598 aa  419  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  38.87 
 
 
601 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  36.67 
 
 
604 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  37.85 
 
 
605 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  37.85 
 
 
605 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  36.05 
 
 
621 aa  385  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  41.72 
 
 
599 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  42.06 
 
 
626 aa  382  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  34.95 
 
 
614 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  43.25 
 
 
619 aa  364  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  34.78 
 
 
606 aa  361  2e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.54 
 
 
600 aa  359  8e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  37.86 
 
 
595 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  34.64 
 
 
604 aa  352  8e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  39.12 
 
 
599 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  38.88 
 
 
587 aa  350  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  37.54 
 
 
595 aa  350  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  38.68 
 
 
588 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  39.96 
 
 
595 aa  343  7e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  39.86 
 
 
593 aa  342  8e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.44 
 
 
587 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  39.21 
 
 
578 aa  334  3e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  40.13 
 
 
703 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  35.74 
 
 
582 aa  329  9e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.16 
 
 
583 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  41.4 
 
 
605 aa  328  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  36.1 
 
 
588 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  34.98 
 
 
599 aa  327  3e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  39.57 
 
 
674 aa  325  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  36.69 
 
 
630 aa  324  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  36.51 
 
 
636 aa  323  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  33.5 
 
 
604 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  34.85 
 
 
596 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.16 
 
 
613 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  36.86 
 
 
613 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  37.8 
 
 
623 aa  317  5e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  37.09 
 
 
632 aa  316  9e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36.16 
 
 
662 aa  316  9e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  43.75 
 
 
655 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  41.42 
 
 
663 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  36.71 
 
 
586 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  37.08 
 
 
653 aa  313  6.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  41.32 
 
 
664 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  42.43 
 
 
663 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  42.42 
 
 
660 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  37.91 
 
 
675 aa  310  5.9999999999999995e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  43.01 
 
 
660 aa  309  9e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  41.95 
 
 
660 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  37.21 
 
 
584 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  42.74 
 
 
660 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  37.01 
 
 
617 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  32.52 
 
 
637 aa  307  4.0000000000000004e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  38.81 
 
 
640 aa  306  6e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  42.55 
 
 
651 aa  306  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  41.33 
 
 
588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  33.77 
 
 
646 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  37.18 
 
 
609 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  33.77 
 
 
646 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  42.39 
 
 
652 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  35.45 
 
 
582 aa  304  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  35.45 
 
 
582 aa  304  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  35.45 
 
 
582 aa  304  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  33.28 
 
 
617 aa  303  7.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  38.36 
 
 
565 aa  302  9e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  36.65 
 
 
633 aa  302  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  41.58 
 
 
586 aa  301  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  42.03 
 
 
638 aa  301  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  30.94 
 
 
605 aa  301  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  38.29 
 
 
602 aa  301  3e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  35.22 
 
 
573 aa  300  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  33.99 
 
 
694 aa  300  5e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  35.76 
 
 
575 aa  299  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  34.81 
 
 
660 aa  299  9e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  37.1 
 
 
660 aa  299  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  42.51 
 
 
660 aa  299  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0995  DNA primase  35.89 
 
 
610 aa  299  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027576  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  39.19 
 
 
603 aa  299  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  35.96 
 
 
704 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  35.61 
 
 
611 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  41.21 
 
 
656 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  39.53 
 
 
651 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  35.92 
 
 
581 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  35.92 
 
 
581 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  35.92 
 
 
581 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  35.92 
 
 
581 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  41.42 
 
 
544 aa  297  4e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  36.08 
 
 
645 aa  297  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>