189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2406 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  100 
 
 		 298 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  89.12 
 
 		 299 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  81.36 
 
 		 298 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4024  endonuclease IV  80.34 
 
 		 298 aa  467  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.98136e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4034  endonuclease IV  80.34 
 
 		 298 aa  467  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000210603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4418  endonuclease IV  80.68 
 
 		 298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000572024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4186  endonuclease IV  80 
 
 		 298 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000147247  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4508  endonuclease IV  80 
 
 		 298 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000301022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4402  endonuclease IV  80.68 
 
 		 298 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00437545  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4306  endonuclease IV  80 
 
 		 298 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61822e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0834  endonuclease IV  80.34 
 
 		 298 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  0.000000117515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4137  endonuclease IV  79.66 
 
 		 298 aa  462  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000492202  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  74.66 
 
 		 296 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  74.32 
 
 		 296 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  74.32 
 
 		 296 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  63.21 
 
 		 300 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4364  endonuclease IV  76.52 
 
 		 250 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000223667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  52.52 
 
 		 282 aa  291  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl333  endonuclease IV  48.12 
 
 		 293 aa  264  1e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144036  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  49.12 
 
 		 280 aa  261  8.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0310  endonuclease IV  48.07 
 
 		 304 aa  258  7e-68  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  47.37 
 
 		 277 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  48.76 
 
 		 277 aa  238  9e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0060  endonuclease IV  42.07 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  45.07 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  45.08 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0735  apurinic endonuclease Apn1  40.91 
 
 		 283 aa  218  8.999999999999998e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.320014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  44.48 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  43.3 
 
 		 277 aa  215  8e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf342  endonuclease IV  41.96 
 
 		 276 aa  210  3e-53  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  40.38 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  39.78 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  35.52 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  39.48 
 
 		 278 aa  188  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  37.36 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  38.72 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  35.5 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  38.21 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  38.46 
 
 		 296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  37.5 
 
 		 296 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  38.06 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  37.97 
 
 		 289 aa  177  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  34.85 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  37.26 
 
 		 293 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  37.31 
 
 		 287 aa  175  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  35.85 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  35.71 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  35.85 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  36.19 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  35.29 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  37.28 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  33.83 
 
 		 283 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  33.08 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  33.46 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  35.74 
 
 		 276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  36.3 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  35.15 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  33.68 
 
 		 280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  35.58 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  34.48 
 
 		 284 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  34.56 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  37.59 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  33.83 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  33.46 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  36.55 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  35.11 
 
 		 281 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  34.96 
 
 		 283 aa  155  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  37.02 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  36.26 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  32.72 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  31.58 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  35.31 
 
 		 282 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  33.97 
 
 		 276 aa  150  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  36.26 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  37.97 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  32.76 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  33.33 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  33.55 
 
 		 285 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  33.96 
 
 		 282 aa  146  5e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  33.55 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  33.89 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  34.33 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  34.97 
 
 		 286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  34.44 
 
 		 284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30161  predicted protein  30.74 
 
 		 379 aa  145  7.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  36.04 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  33.08 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  34.02 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  34.02 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  32.45 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  34.02 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  35.11 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2760  endonuclease IV  33.91 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  33.1 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  33.68 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  33.68 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  33.58 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1927  endonuclease IV  33.7 
 
 		 281 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0277  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  32.56 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  33.68 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>