More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2316 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  62.06 
 
 
579 aa  724    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  61.89 
 
 
583 aa  730    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  100 
 
 
573 aa  1160    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  79.02 
 
 
573 aa  939    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  61.89 
 
 
579 aa  727    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  61.89 
 
 
579 aa  729    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  61.89 
 
 
583 aa  728    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  62.41 
 
 
579 aa  732    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  61.89 
 
 
579 aa  727    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  61.89 
 
 
579 aa  728    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  63.11 
 
 
579 aa  730    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  62.06 
 
 
579 aa  729    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  62.24 
 
 
579 aa  730    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  45.88 
 
 
559 aa  505  1e-141  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  44.37 
 
 
556 aa  481  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  45.17 
 
 
555 aa  478  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  45.23 
 
 
552 aa  470  1.0000000000000001e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  44.35 
 
 
558 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  41.95 
 
 
555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  43.74 
 
 
559 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  43.74 
 
 
559 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  41.42 
 
 
566 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 
558 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  38.56 
 
 
555 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  40.21 
 
 
570 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  38.89 
 
 
567 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 
554 aa  405  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  40.35 
 
 
565 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  38.38 
 
 
562 aa  403  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  37.74 
 
 
577 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  38.91 
 
 
601 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  38.72 
 
 
565 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  39.35 
 
 
599 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  38.56 
 
 
554 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  38.42 
 
 
565 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  39.16 
 
 
565 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  38.46 
 
 
586 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  37.89 
 
 
557 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  37.89 
 
 
562 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  36.11 
 
 
580 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  37.35 
 
 
561 aa  373  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  37.54 
 
 
572 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  39.23 
 
 
553 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  38.73 
 
 
551 aa  374  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 
551 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  38 
 
 
556 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  36.97 
 
 
587 aa  365  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  39.4 
 
 
553 aa  363  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  37.08 
 
 
574 aa  363  5.0000000000000005e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  38.69 
 
 
552 aa  361  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  35.73 
 
 
578 aa  355  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  38.99 
 
 
572 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.11 
 
 
572 aa  352  8.999999999999999e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  38.43 
 
 
553 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  34.74 
 
 
574 aa  349  8e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  34.56 
 
 
560 aa  347  3e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 
588 aa  347  4e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  35.8 
 
 
554 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  35.99 
 
 
588 aa  344  2e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  35.8 
 
 
554 aa  345  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  36.65 
 
 
554 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  35.7 
 
 
561 aa  343  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  33.56 
 
 
575 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  36.16 
 
 
588 aa  340  4e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  36.43 
 
 
560 aa  340  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  35.37 
 
 
569 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  33.5 
 
 
605 aa  333  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  37.31 
 
 
558 aa  331  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  33.39 
 
 
565 aa  326  8.000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6056  DNA repair and genetic recombination  32.41 
 
 
570 aa  326  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143027  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.1 
 
 
559 aa  326  8.000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5429  DNA repair protein RecN  31.95 
 
 
580 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.477052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  34.74 
 
 
554 aa  322  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  33.45 
 
 
554 aa  320  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  34.65 
 
 
562 aa  320  6e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  36.25 
 
 
582 aa  319  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  36.64 
 
 
551 aa  318  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  31.88 
 
 
559 aa  318  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 
558 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 
567 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  32.46 
 
 
553 aa  317  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2011  DNA repair protein RecN  32.39 
 
 
580 aa  317  5e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal  0.0516704 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  33.74 
 
 
608 aa  316  6e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  33.68 
 
 
574 aa  316  6e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25450  DNA replication and repair protein RecN  31.73 
 
 
593 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  33.74 
 
 
556 aa  315  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  34.27 
 
 
564 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  34.03 
 
 
568 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  34.26 
 
 
561 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0354  DNA repair protein RecN  36.06 
 
 
542 aa  310  4e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  34.74 
 
 
549 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 
558 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  33.68 
 
 
554 aa  310  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  32.34 
 
 
552 aa  310  5e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  32.34 
 
 
552 aa  310  5e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  34.44 
 
 
556 aa  310  5.9999999999999995e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  31.87 
 
 
552 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  31.87 
 
 
552 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  31.87 
 
 
552 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  31.69 
 
 
552 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>