More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2284 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  58.61 
 
 		 517 aa  637    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  67.25 
 
 		 515 aa  698    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  63.57 
 
 		 516 aa  687    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  60.88 
 
 		 519 aa  640    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  61.86 
 
 		 513 aa  650    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  100 
 
 		 522 aa  1066    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  65.63 
 
 		 512 aa  683    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  60.74 
 
 		 517 aa  669    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  59.77 
 
 		 522 aa  646    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  64.45 
 
 		 516 aa  698    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  62.01 
 
 		 519 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  61.75 
 
 		 528 aa  659    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  61.05 
 
 		 520 aa  637    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  63.76 
 
 		 514 aa  654    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  60.16 
 
 		 516 aa  640    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  67.05 
 
 		 512 aa  705    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  68.17 
 
 		 508 aa  702    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  64.86 
 
 		 518 aa  709    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  58.59 
 
 		 531 aa  635    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  94.38 
 
 		 516 aa  982    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  62.6 
 
 		 514 aa  664    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  61.87 
 
 		 516 aa  654    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  64.48 
 
 		 521 aa  672    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  60.23 
 
 		 513 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  67.45 
 
 		 515 aa  699    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  64.41 
 
 		 516 aa  697    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  61.28 
 
 		 531 aa  655    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  60 
 
 		 520 aa  632  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  62.75 
 
 		 550 aa  632  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  61.43 
 
 		 518 aa  632  1e-180  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  59.19 
 
 		 510 aa  628  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  60.23 
 
 		 513 aa  626  1e-178  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  58.83 
 
 		 514 aa  626  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  61.94 
 
 		 516 aa  625  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  58.9 
 
 		 512 aa  625  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  60.62 
 
 		 514 aa  626  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  59.81 
 
 		 510 aa  627  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  59.61 
 
 		 510 aa  626  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  60.62 
 
 		 519 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  60.96 
 
 		 520 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  59.81 
 
 		 510 aa  622  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  57.03 
 
 		 517 aa  624  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  61.08 
 
 		 519 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  59.22 
 
 		 510 aa  619  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  60.35 
 
 		 510 aa  620  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  61.08 
 
 		 519 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  57.06 
 
 		 516 aa  619  1e-176  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  59.5 
 
 		 510 aa  620  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  61.77 
 
 		 516 aa  618  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  56.67 
 
 		 516 aa  614  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  59.38 
 
 		 522 aa  616  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  58.28 
 
 		 564 aa  616  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  58.14 
 
 		 511 aa  612  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  58.25 
 
 		 510 aa  614  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  57.98 
 
 		 510 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  59.3 
 
 		 513 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  57.79 
 
 		 513 aa  612  9.999999999999999e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  58.75 
 
 		 510 aa  614  9.999999999999999e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  56.67 
 
 		 516 aa  614  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  59.07 
 
 		 516 aa  608  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  54.2 
 
 		 524 aa  610  1e-173  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  57.98 
 
 		 510 aa  611  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  61.76 
 
 		 516 aa  609  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  56.59 
 
 		 510 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  57.86 
 
 		 510 aa  608  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  57.89 
 
 		 524 aa  605  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  58.79 
 
 		 530 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  55.49 
 
 		 517 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  57.62 
 
 		 510 aa  604  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  56.98 
 
 		 510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3541  carboxyl transferase  58.09 
 
 		 514 aa  604  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  57.2 
 
 		 510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  58.88 
 
 		 518 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  57.36 
 
 		 513 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  57.36 
 
 		 510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  57.28 
 
 		 518 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  58.09 
 
 		 529 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  58.03 
 
 		 510 aa  603  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  56.8 
 
 		 523 aa  598  1e-170  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  57.59 
 
 		 513 aa  600  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  57.28 
 
 		 510 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  56.08 
 
 		 527 aa  599  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  58.01 
 
 		 540 aa  598  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  56.84 
 
 		 510 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  56.61 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  57.63 
 
 		 531 aa  596  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  57.12 
 
 		 527 aa  597  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  56.61 
 
 		 510 aa  598  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  56.61 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1157  propionyl-CoA carboxylase, beta subunit  57.65 
 
 		 508 aa  594  1e-168  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.167256  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  57.39 
 
 		 510 aa  594  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1401  carboxyl transferase  56.81 
 
 		 510 aa  592  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0947587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  57.28 
 
 		 510 aa  593  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0808  carboxyl transferase  57.2 
 
 		 508 aa  594  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  57.17 
 
 		 546 aa  592  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1579  carboxyl transferase  56.29 
 
 		 523 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0377813  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  56.02 
 
 		 537 aa  594  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1342  carboxyl transferase  55.43 
 
 		 511 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525317  normal  0.223983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1248  carboxyl transferase  56.23 
 
 		 522 aa  592  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2771  carboxyl transferase  57.61 
 
 		 549 aa  590  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>