More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2238 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  77.21 
 
 		 214 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 214 aa  284  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  60.28 
 
 		 214 aa  280  8.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 214 aa  263  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  64.49 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  64.49 
 
 		 214 aa  262  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  63.55 
 
 		 214 aa  261  8e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  52.29 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  52.04 
 
 		 217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  51.4 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  48.18 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  51.53 
 
 		 215 aa  216  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  49.78 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 217 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  48.84 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  52.07 
 
 		 218 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  50.47 
 
 		 216 aa  210  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  49.53 
 
 		 215 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  48.61 
 
 		 216 aa  205  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  46.89 
 
 		 239 aa  203  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  45.79 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 207 aa  198  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  46.51 
 
 		 217 aa  198  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  46.54 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1327  riboflavin synthase subunit alpha  48.13 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.254294  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  47.44 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  46.98 
 
 		 215 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  52.15 
 
 		 187 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  48.28 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  53.27 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  46.7 
 
 		 199 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  45.05 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  49.53 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  44.19 
 
 		 217 aa  191  9e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  50.52 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  46.33 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  47.2 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  45.79 
 
 		 213 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  43.32 
 
 		 219 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  47.66 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  45.87 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  45.87 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  45.87 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  44.24 
 
 		 220 aa  187  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  47.2 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  44.19 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  49.23 
 
 		 199 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 216 aa  185  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1857  riboflavin synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1822  riboflavin synthase subunit alpha  45.83 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.295003  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  43.06 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  43.78 
 
 		 220 aa  184  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  41.86 
 
 		 216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  51.58 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  44.7 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  48.76 
 
 		 205 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  42.2 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  44.29 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 218 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  43.26 
 
 		 221 aa  178  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  48.7 
 
 		 202 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  42.65 
 
 		 204 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  43.98 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  46.57 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.06 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  46.5 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  45.05 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  42.2 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  42.4 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>