239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2220 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2220  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  100 
 
 		 395 aa  790    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0401  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  90.38 
 
 		 397 aa  729    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1398  cytochrome c assembly protein  73.03 
 
 		 385 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.720843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1600  resC protein  72.52 
 
 		 385 aa  598  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1358  cytochrome c biogenesis protein  72.52 
 
 		 385 aa  598  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0913399  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1357  cytochrome c biogenesis protein  72.52 
 
 		 385 aa  598  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1530  resC protein  73.03 
 
 		 385 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1199  cytochrome c assembly protein  72.77 
 
 		 385 aa  598  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1636  resC protein  72.26 
 
 		 385 aa  597  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0783645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1568  resC protein  72.26 
 
 		 385 aa  598  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6021100000000005e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3815  resC protein  72.26 
 
 		 385 aa  598  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000474792 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1385  resC protein  72.01 
 
 		 385 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0185485  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1496  resC protein  72.01 
 
 		 385 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0749  cytochrome c assembly protein  28.54 
 
 		 472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.49 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.49 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  30.56 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.88 
 
 		 350 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4837  cytochrome c assembly protein  29.8 
 
 		 442 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294706  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0774  cytochrome c assembly protein  30.4 
 
 		 465 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.52 
 
 		 444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374119  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0666  cytochrome c assembly protein  27.56 
 
 		 463 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal  0.0198915 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0712  cytochrome c assembly protein  26.98 
 
 		 444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3251  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.21 
 
 		 351 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.248135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0986  cytochrome c assembly protein  27.97 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5587  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.65 
 
 		 446 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.42 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  54.08 
 
 		 346 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  52.17 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  47.69 
 
 		 271 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1133  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.75 
 
 		 438 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  31.2 
 
 		 329 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.92 
 
 		 271 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0434  putative cytochrome c asssembly protein  29.15 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.105274  normal  0.205387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  46.92 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  49.23 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.53 
 
 		 328 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  55.67 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  48.03 
 
 		 278 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  54.46 
 
 		 321 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50 
 
 		 271 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  39.67 
 
 		 282 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  49.59 
 
 		 330 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.24 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  54.46 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  51.02 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4512  cytochrome c assembly protein  57.14 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  42.86 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  52.58 
 
 		 283 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  50.51 
 
 		 284 aa  119  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  53.47 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  52.04 
 
 		 284 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  51.02 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  49.51 
 
 		 284 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  49 
 
 		 284 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  36.22 
 
 		 283 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  52.43 
 
 		 326 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  52.43 
 
 		 326 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  52.43 
 
 		 326 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2820  cytochrome c assembly protein  52.43 
 
 		 326 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6117  cytochrome c assembly protein  52.04 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.242647  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  46.46 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  49 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  37.81 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  37.44 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  49.12 
 
 		 324 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0695  cytochrome c assembly protein  54.08 
 
 		 334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0708  cytochrome c assembly protein  54.08 
 
 		 334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.034343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0688  cytochrome c assembly protein  54.08 
 
 		 334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  40.4 
 
 		 324 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0513  cytochrome c assembly protein  51.02 
 
 		 397 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525112  normal  0.322787 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  49.02 
 
 		 282 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  46.72 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0447  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  47.96 
 
 		 321 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  50 
 
 		 283 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  45.9 
 
 		 315 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  53.61 
 
 		 309 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  53.61 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0631  cytochrome c assembly protein  42.86 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.244792  hitchhiker  0.001469 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  52.58 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  49.48 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  50.52 
 
 		 351 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.62 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  49.09 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2200  cytochrome c assembly protein  45.76 
 
 		 327 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  50.98 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  47.06 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0504  cytochrome c assembly protein  50 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0350668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0185  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  36.2 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107492  normal  0.161414 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4574  cytochrome c assembly protein  42.06 
 
 		 360 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  46.9 
 
 		 311 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4471  cytochrome c assembly protein  47.96 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4302  cytochrome c assembly protein  47.96 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.694809  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4202  cytochrome c assembly protein  47.96 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  44.12 
 
 		 339 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0234  cytochrome c assembly protein  33.64 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  37.2 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  50.52 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3282  cytochrome c assembly protein  49.02 
 
 		 407 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3289  cytochrome c assembly protein  47.96 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>