More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2212 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  100 
 
 
318 aa  643    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  80.82 
 
 
318 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  35.26 
 
 
322 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  41.97 
 
 
315 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  41.05 
 
 
315 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  39.44 
 
 
307 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  35.16 
 
 
341 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0266  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein, putative  41.57 
 
 
295 aa  200  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0647  periplasmic binding protein  36.66 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0632  periplasmic binding protein  36.66 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  37.81 
 
 
331 aa  196  6e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  36.05 
 
 
337 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  39.64 
 
 
300 aa  185  9e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  35.4 
 
 
338 aa  183  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  35.4 
 
 
338 aa  183  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  35.37 
 
 
338 aa  182  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  35.11 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  34.63 
 
 
335 aa  179  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  36.88 
 
 
318 aa  176  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  35.69 
 
 
351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  33.77 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  33.97 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  35.97 
 
 
321 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  31.03 
 
 
322 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  30.86 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  32.97 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  34.93 
 
 
363 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  30.56 
 
 
305 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  30.46 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  32.21 
 
 
339 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0656  ABC Fe3+-hydroxamate transporter substrate-binding protein  34.27 
 
 
308 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3079  periplasmic binding protein  31.9 
 
 
291 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498127  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  32.22 
 
 
296 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  32.39 
 
 
289 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  34.28 
 
 
328 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2621  periplasmic binding protein  35.38 
 
 
299 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  32.51 
 
 
289 aa  146  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0218  periplasmic binding protein  31.1 
 
 
333 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.311188  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1231  periplasmic binding protein  31.53 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.432846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  27.87 
 
 
303 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  33.92 
 
 
297 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  33.57 
 
 
299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  32.01 
 
 
356 aa  136  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  29.85 
 
 
317 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2132  periplasmic binding protein  30.43 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334395 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0535  periplasmic binding protein  28.77 
 
 
314 aa  132  6e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_68  cobalamin-binding protein  31.29 
 
 
517 aa  132  6e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4774  periplasmic binding protein  32.26 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.739783  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  30.45 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0512  iron(III) dicitrate-binding protein  29.71 
 
 
314 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.1381  normal  0.0960859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3729  periplasmic binding protein  31.91 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685211  hitchhiker  0.00414028 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  30.69 
 
 
478 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  31.41 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1830  periplasmic binding protein  33.1 
 
 
360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  29.25 
 
 
313 aa  126  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  31.5 
 
 
296 aa  126  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0895  periplasmic binding protein  32.05 
 
 
288 aa  125  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  33.7 
 
 
304 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2494  periplasmic binding protein  27.71 
 
 
406 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004473  vitamin B12 ABC transporter B12-binding component BtuF  29.13 
 
 
274 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  29.76 
 
 
275 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3615  periplasmic binding protein  31.58 
 
 
304 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3205  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.66 
 
 
309 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2853  periplasmic binding protein  31.08 
 
 
294 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1540  periplasmic binding protein  28.31 
 
 
323 aa  123  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000147526  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.71 
 
 
287 aa  123  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3547  periplasmic binding protein  31.7 
 
 
304 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3204  periplasmic binding protein  29.33 
 
 
333 aa  122  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2782  periplasmic binding protein  32.03 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.732932  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2550  periplasmic binding protein  31.41 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  30.94 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3272  periplasmic binding protein  30.74 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  32.04 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2791  periplasmic binding protein  26.15 
 
 
377 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1959  hypothetical protein  29.88 
 
 
276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  30.8 
 
 
278 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2522  periplasmic binding protein  29.81 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.760229 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  30.57 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2947  periplasmic binding protein  32.28 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1119  periplasmic binding protein  32.81 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00373301  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4501  periplasmic binding protein  29.35 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.927448  normal  0.0870716 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2664  periplasmic binding protein  28.52 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  27.27 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1449  periplasmic binding protein  29.31 
 
 
316 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301306  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2491  periplasmic binding protein  31.92 
 
 
261 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2734  ABC transporter substrate binding protein (hemin)  29.24 
 
 
312 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.702992  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1178  vitamin B12-transporter protein BtuF  29.41 
 
 
275 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  30.08 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3464  periplasmic binding protein  31.7 
 
 
304 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  29.64 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  28.17 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2808  periplasmic binding protein  28.85 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00921  ABC-type Fe3+-siderophore transporter  28.96 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28050  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.98 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3729  periplasmic binding protein  29.76 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  normal  0.0538393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2364  periplasmic binding protein  30.25 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.38234  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2207  periplasmic binding protein  28.16 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00190614  normal  0.612299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0419  periplasmic binding protein  29.89 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.892372 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4081  periplasmic binding protein  30.37 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.031541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>