More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2169 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2169  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 387 aa  758    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000104963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0455  30S ribosomal protein S1  82.47 
 
 		 387 aa  625  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1221  30S ribosomal protein S1  61.54 
 
 		 382 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000730459  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1625  30S ribosomal protein S1  62.31 
 
 		 382 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1408  30S ribosomal protein S1  62.05 
 
 		 382 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000102607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1380  30S ribosomal protein S1  62.05 
 
 		 382 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1379  30S ribosomal protein S1  62.05 
 
 		 382 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000385959  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1519  30S ribosomal protein S1  62.05 
 
 		 382 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000156073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3791  30S ribosomal protein S1  61.79 
 
 		 382 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784339  hitchhiker  0.000188764 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1553  30S ribosomal protein S1  61.79 
 
 		 382 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00270143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1592  30S ribosomal protein S1  62.05 
 
 		 382 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0386100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1421  30S ribosomal protein S1  61.28 
 
 		 382 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00177938  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1661  30S ribosomal protein S1  62.05 
 
 		 382 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1563  30S ribosomal protein S1  47.06 
 
 		 391 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.909441  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1533  30S ribosomal protein S1  47.06 
 
 		 391 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.920483  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0763  30S ribosomal protein S1  43.24 
 
 		 416 aa  332  5e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000378884  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1178  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  45.09 
 
 		 677 aa  332  9e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.426785  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1703  RNA binding S1 domain protein  48.72 
 
 		 385 aa  329  6e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000241805  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1044  30S ribosomal protein S1  47.31 
 
 		 392 aa  328  9e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1329  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  44.41 
 
 		 736 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000119457  normal  0.0289615 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2102  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  45.03 
 
 		 676 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.573374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1154  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  45.53 
 
 		 672 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1292  SSU ribosomal protein S1P  47.11 
 
 		 396 aa  312  5.999999999999999e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00025498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1638  hydroxymethylbutenyl pyrophosphate reductase  44.13 
 
 		 705 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.32153 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  48.68 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1146  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  44.68 
 
 		 654 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  43.88 
 
 		 678 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0896  30S ribosomal protein S1  43.99 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000252731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3385  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  44.16 
 
 		 661 aa  295  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000070499  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1344  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  43.43 
 
 		 687 aa  294  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0642692  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  47.75 
 
 		 405 aa  293  3e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  44.94 
 
 		 529 aa  286  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1577  30S ribosomal protein S1  44.2 
 
 		 587 aa  283  3.0000000000000004e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00419028  normal  0.668764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  45.51 
 
 		 495 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  40.36 
 
 		 399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  43.96 
 
 		 515 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  47.32 
 
 		 407 aa  280  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  44.29 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  44.29 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  44.29 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  44.03 
 
 		 427 aa  280  3e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  45.22 
 
 		 495 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  44.29 
 
 		 487 aa  280  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  44.63 
 
 		 481 aa  279  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  44.63 
 
 		 481 aa  279  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  44.48 
 
 		 493 aa  278  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  46.13 
 
 		 598 aa  278  9e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  44.19 
 
 		 490 aa  278  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  43.73 
 
 		 481 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  45.05 
 
 		 418 aa  277  2e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  45.29 
 
 		 488 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  42.98 
 
 		 500 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  44.44 
 
 		 485 aa  276  6e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  44.76 
 
 		 499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  43.45 
 
 		 493 aa  273  3e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  43.45 
 
 		 493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  44.71 
 
 		 491 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  44.71 
 
 		 491 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  43.8 
 
 		 490 aa  273  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  43.93 
 
 		 491 aa  272  6e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  44.41 
 
 		 492 aa  272  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  44.12 
 
 		 480 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  42.82 
 
 		 487 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  43.43 
 
 		 485 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  43.66 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  43.6 
 
 		 488 aa  269  5e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0639  30S ribosomal protein S1  42.46 
 
 		 400 aa  269  5e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.136649  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1150  30S ribosomal protein S1  44.26 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000136012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  43.38 
 
 		 496 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2948  30S ribosomal protein S1  44.6 
 
 		 505 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.188906 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  43.94 
 
 		 500 aa  267  2e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  44.41 
 
 		 488 aa  266  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  42.9 
 
 		 496 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  43.43 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  44.21 
 
 		 492 aa  264  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  40.72 
 
 		 720 aa  263  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  44.2 
 
 		 558 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  45.29 
 
 		 493 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  45.29 
 
 		 493 aa  260  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1728  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  41.09 
 
 		 672 aa  259  6e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0455896  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  42.3 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0714  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase/S1 RNA-binding domain protein  42.35 
 
 		 694 aa  256  5e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000369991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.89 
 
 		 411 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2024  SSU ribosomal protein S1P  45.23 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  37.96 
 
 		 644 aa  249  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2405  30S ribosomal protein S1  37.08 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2117  30S ribosomal protein S1  37.08 
 
 		 378 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  40.53 
 
 		 557 aa  246  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.65 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3767  RNA binding S1 domain-containing protein  42.3 
 
 		 507 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0768989  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0502  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.94 
 
 		 415 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5663  RNA binding S1 domain protein  37.53 
 
 		 595 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  38.11 
 
 		 557 aa  242  7e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  37.74 
 
 		 562 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  37.74 
 
 		 562 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  40 
 
 		 584 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  37.74 
 
 		 562 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  39.58 
 
 		 596 aa  238  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  37.47 
 
 		 564 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  37.47 
 
 		 564 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>