292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2136 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  100 
 
 
367 aa  757    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  80.6 
 
 
367 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  53.55 
 
 
369 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  53.28 
 
 
378 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  53.01 
 
 
366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  53.55 
 
 
366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  53.28 
 
 
366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  53.01 
 
 
378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  53.01 
 
 
366 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  53.28 
 
 
366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  53.28 
 
 
366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  53.28 
 
 
366 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  47.25 
 
 
363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  47.25 
 
 
363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  46.96 
 
 
362 aa  328  6e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  40.28 
 
 
368 aa  285  7e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1908  prephenate dehydrogenase  42.94 
 
 
354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  39.55 
 
 
364 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  39.54 
 
 
366 aa  255  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  36.97 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  37.43 
 
 
373 aa  239  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  37.93 
 
 
365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  37.78 
 
 
375 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2539  prephenate dehydrogenase  38.66 
 
 
369 aa  233  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213601  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  35.15 
 
 
364 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  34.64 
 
 
370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  39.27 
 
 
334 aa  219  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  40.86 
 
 
742 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  37.05 
 
 
290 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  37.28 
 
 
286 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  38.13 
 
 
288 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  36.92 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  38.08 
 
 
288 aa  199  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  37.77 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2857  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.82 
 
 
748 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0613537  hitchhiker  0.0000000406549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  39.52 
 
 
295 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  36 
 
 
360 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  38.19 
 
 
293 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  38.19 
 
 
293 aa  193  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  37.59 
 
 
299 aa  192  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0844  Prephenate dehydrogenase  36.84 
 
 
280 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  35.25 
 
 
286 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  38.41 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  38.43 
 
 
286 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  38.49 
 
 
286 aa  188  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  36.36 
 
 
319 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  35.11 
 
 
313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.59 
 
 
750 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
360 aa  182  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  36.7 
 
 
292 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1163  prephenate dehydrogenase  36.52 
 
 
283 aa  180  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1209  Prephenate dehydrogenase  34.41 
 
 
293 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0228431  normal  0.063909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  36.52 
 
 
534 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.1 
 
 
311 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  36.86 
 
 
280 aa  177  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0906  putative prephenate dehydrogenase oxidoreductase protein  37.93 
 
 
298 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.76 
 
 
735 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1361  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.94 
 
 
746 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290163  normal  0.0329548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1770  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.94 
 
 
746 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151149  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3944  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.94 
 
 
746 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  38.36 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  35.94 
 
 
289 aa  175  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0953  prephenate dehydrogenase  38.35 
 
 
288 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02487  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0847  Prephenate dehydrogenase  36.84 
 
 
292 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.16 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  39.24 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0776  Prephenate dehydrogenase  36.84 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00454993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0176  prephenate dehydrogenase  36.65 
 
 
286 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.327955  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  37.99 
 
 
298 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4255  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.97 
 
 
313 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.63 
 
 
314 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.68 
 
 
746 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0718  prephenate dehydrogenase  38.71 
 
 
302 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  35.74 
 
 
290 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  36.65 
 
 
535 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.69 
 
 
311 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  34.26 
 
 
322 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.54 
 
 
746 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.57 
 
 
314 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  32.02 
 
 
379 aa  169  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.59 
 
 
746 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3229  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.65 
 
 
312 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  35.02 
 
 
334 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  38.38 
 
 
329 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  38.38 
 
 
329 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  34.71 
 
 
328 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  34.39 
 
 
328 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.59 
 
 
752 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.12 
 
 
311 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.38 
 
 
312 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.59 
 
 
745 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
330 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.79 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.59 
 
 
746 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  34.48 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.03 
 
 
321 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.08 
 
 
310 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.67 
 
 
321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.37 
 
 
307 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0673  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.38 
 
 
313 aa  166  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>