247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2050 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0694  transposase  100 
 
 
478 aa  995    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000208331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2050  transposase  100 
 
 
478 aa  995    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0319  transposase  97.87 
 
 
470 aa  959    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0539  transposase  100 
 
 
478 aa  995    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000512999  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0982  ISCpe7, transposase  24.27 
 
 
340 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1313  ISCpe7, transposase  24.27 
 
 
340 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0190357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0681  ISCpe7, transposase  23.73 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0802  ISCpe7, transposase  23.73 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0691516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0947  ISCpe7, transposase  23.53 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0680749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1537  ISCpe7, transposase  23.73 
 
 
340 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.10688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0784  ISCpe7, transposase  23.73 
 
 
340 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.653929  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0809  ISCpe7, transposase  23.53 
 
 
340 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.313897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0755  integrase catalytic subunit  23.94 
 
 
343 aa  99  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000147635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2179  Integrase catalytic region  22.67 
 
 
353 aa  87  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521095  hitchhiker  1.88153e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2243  Integrase catalytic region  22.67 
 
 
353 aa  87  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.781166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1912  Integrase catalytic region  22.67 
 
 
353 aa  87  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1065  Integrase catalytic region  22.67 
 
 
353 aa  87  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.106559 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0243  Integrase catalytic region  22.67 
 
 
353 aa  87  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0037  Integrase catalytic region  22.67 
 
 
353 aa  87  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2409  Integrase catalytic region  22.67 
 
 
353 aa  87  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2640  Integrase catalytic region  22.28 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1944  Integrase catalytic region  22.28 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.704589  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2422  Integrase catalytic region  22.28 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0674  Integrase catalytic region  22.28 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1473  ISCpe7, transposase  23.25 
 
 
253 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.804077  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  28 
 
 
222 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1190  ISCpe7, transposase  26.85 
 
 
137 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0283879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0634  ISCpe7, transposase  25.68 
 
 
156 aa  63.9  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0930  ISCpe7, transposase  25.68 
 
 
156 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00303612  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  29.2 
 
 
235 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4428  ISPsy24 transposase OrfB  26.99 
 
 
303 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  27.5 
 
 
248 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  27.5 
 
 
248 aa  60.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4697  hypothetical protein  26.99 
 
 
275 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2525  hypothetical protein  26.99 
 
 
275 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0620209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2390  hypothetical protein  26.99 
 
 
275 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4229  hypothetical protein  26.99 
 
 
275 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4796  hypothetical protein  26.99 
 
 
275 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  27.36 
 
 
238 aa  59.7  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  26.99 
 
 
269 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  28.47 
 
 
235 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  28.47 
 
 
235 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2973  integrase catalytic region  25.75 
 
 
269 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157754  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0757  integrase catalytic region  25.75 
 
 
269 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  26.79 
 
 
179 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2953  integrase catalytic region  25.75 
 
 
269 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.771185  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0626  integrase catalytic region  25.75 
 
 
269 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000744375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1763  integrase catalytic region  25.75 
 
 
269 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1549  integrase catalytic region  25.75 
 
 
269 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  hitchhiker  0.00000192905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3363  integrase catalytic region  25.75 
 
 
269 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.482231 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4863  Integrase catalytic region  26.32 
 
 
225 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  26.25 
 
 
248 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  26.25 
 
 
248 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  25 
 
 
235 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  27.7 
 
 
225 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3224  transposase  26.32 
 
 
226 aa  57.8  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  25.7 
 
 
202 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  24.87 
 
 
263 aa  57.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6036  ISSod1 transposase  27.04 
 
 
272 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2834  hypothetical protein  26.38 
 
 
275 aa  57  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  27.89 
 
 
218 aa  57  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  27.74 
 
 
215 aa  57  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  27.69 
 
 
255 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4696  ISPsy13, transposase OrfB  28.22 
 
 
429 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4966  Integrase catalytic region  25 
 
 
225 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51630  transposase  26.38 
 
 
281 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000258356  hitchhiker  0.0000489027 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  26.5 
 
 
226 aa  55.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  26.25 
 
 
248 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  26.5 
 
 
226 aa  55.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  26.5 
 
 
226 aa  55.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  26.5 
 
 
226 aa  55.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2282  integrase catalytic region  25.62 
 
 
270 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.201248  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4251  integrase catalytic region  25.62 
 
 
270 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2335  integrase catalytic region  25.62 
 
 
270 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0553518  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4414  integrase catalytic region  25.62 
 
 
270 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4047  Integrase catalytic region  25.36 
 
 
225 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2351  transposase IS3/IS911 family protein  25.62 
 
 
392 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.104982  normal  0.978372 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4400  transposase IS3/IS911 family protein  25.62 
 
 
392 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.55958 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1642  integrase catalytic subunit  24.7 
 
 
271 aa  53.9  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1859  integrase catalytic subunit  24.7 
 
 
271 aa  53.9  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2076  integrase catalytic subunit  24.7 
 
 
271 aa  53.9  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4651  integrase catalytic region  25.62 
 
 
270 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  24.37 
 
 
341 aa  54.3  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2697  transposase IS3/IS911 family protein  25.62 
 
 
392 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000367246  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3580  hypothetical protein  34.95 
 
 
108 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  31.78 
 
 
198 aa  54.3  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03300  hypothetical protein  25.77 
 
 
281 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000317239  unclonable  8.68151e-22 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  31.48 
 
 
226 aa  54.3  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  31.48 
 
 
226 aa  54.3  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0725  integrase catalytic subunit  25.62 
 
 
270 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1347  integrase catalytic subunit  25.62 
 
 
270 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1935  integrase catalytic subunit  25.62 
 
 
270 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3314  integrase catalytic subunit  26.99 
 
 
270 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4039  integrase catalytic subunit  25.62 
 
 
270 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4291  integrase catalytic subunit  25.62 
 
 
270 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.940377  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  31.48 
 
 
226 aa  53.9  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  31.48 
 
 
226 aa  53.9  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1015  transposase  29.29 
 
 
134 aa  53.9  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.653024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3145  integrase catalytic subunit  25 
 
 
270 aa  53.5  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.330939  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3615  integrase catalytic subunit  25 
 
 
270 aa  53.5  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>