44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1895 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1895  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  511  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.455689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2055  hypothetical protein  31.85 
 
 
260 aa  139  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.754241  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2786  YcgL  37.61 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.436612 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0459  hypothetical protein  35.05 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0331  hypothetical protein  33.64 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4907  hypothetical protein  35.45 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0348  hypothetical protein  34.11 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0363  hypothetical protein  34.11 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0411  hypothetical protein  35 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0397  hypothetical protein  34.11 
 
 
260 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0343  hypothetical protein  33.18 
 
 
260 aa  125  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0463  hypothetical protein  33.64 
 
 
260 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0339  hypothetical protein  34.58 
 
 
263 aa  118  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4261  hypothetical protein  30.74 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.170436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4570  hypothetical protein  35.08 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1947  hypothetical protein  32.16 
 
 
262 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60660  putative nucleotidyltransferase  31.5 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0225  hypothetical protein  33.03 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0283  YcgL  33.8 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1192  hypothetical protein  35.02 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0937116  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0599  hypothetical protein  36.31 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0679  nucleotidyltransferase-like protein  33.7 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0488  Nucleotidyltransferase, predicted  29.48 
 
 
263 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3691  nucleotidyltransferase-like protein  32.61 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2418  nucleotidyltransferase-like  32.07 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0545252  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4672  nucleotidyltransferase-like  32.61 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.934446  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0405  hypothetical protein  30.71 
 
 
263 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3830  nucleotidyltransferase-like protein  32.07 
 
 
271 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.317709  normal  0.499468 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03910  predicted nucleotidyltransferase  31.42 
 
 
265 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.125701  normal  0.806026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0124  hypothetical protein  33.89 
 
 
259 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.045429  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1192  nucleotidyltransferase-like protein  29.84 
 
 
262 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5431  nucleotidyltransferase-like protein  31.52 
 
 
270 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0334  hypothetical protein  32.11 
 
 
237 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3586  nucleotidyltransferase-like protein  31.52 
 
 
270 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.545722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3841  hypothetical protein  34.43 
 
 
273 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0169  hypothetical protein  32.16 
 
 
270 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.634094  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1054  hypothetical protein  33.33 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1947  nucleotidyltransferase-like  25.13 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.685938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0487  Nucleotidyltransferase, predicted  31.63 
 
 
321 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3163  Nucleotidyltransferase, predicted  30.38 
 
 
356 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2874  hypothetical protein  32.93 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2984  hypothetical protein  32.56 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1055  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3904  nucleotidyltransferase-like protein  32.1 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377103  normal  0.358768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>