More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1853 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
387 aa  758    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  66.41 
 
 
389 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  40.81 
 
 
392 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  42.74 
 
 
370 aa  286  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  37 
 
 
391 aa  223  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 
427 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  35.48 
 
 
386 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  35.2 
 
 
416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  33.42 
 
 
416 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  36.31 
 
 
407 aa  199  9e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  34.7 
 
 
426 aa  196  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  34.95 
 
 
398 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
398 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
425 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  32.9 
 
 
444 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  33.69 
 
 
412 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  32.35 
 
 
424 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  32.83 
 
 
439 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 
421 aa  179  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 
423 aa  179  8e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  33.16 
 
 
428 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
408 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  33.9 
 
 
419 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  33.33 
 
 
421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  32.21 
 
 
414 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  32.86 
 
 
405 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  31.01 
 
 
419 aa  170  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  31.97 
 
 
414 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  29.06 
 
 
388 aa  170  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  32.6 
 
 
387 aa  170  4e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  29.06 
 
 
388 aa  170  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  30.9 
 
 
416 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 
411 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  28.79 
 
 
387 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  30.88 
 
 
422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  31.97 
 
 
424 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  33.42 
 
 
400 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  32.48 
 
 
428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 
402 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0314  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  33.7 
 
 
400 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  32.22 
 
 
428 aa  163  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  30.36 
 
 
417 aa  162  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  33.15 
 
 
400 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 
406 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 
434 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  31.45 
 
 
408 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  33.06 
 
 
415 aa  155  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  28.49 
 
 
398 aa  155  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  31.47 
 
 
417 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  29.68 
 
 
405 aa  152  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  33.15 
 
 
400 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  33.15 
 
 
400 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  31.03 
 
 
401 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2993  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
394 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0641153  normal  0.947318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  33.15 
 
 
400 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  32.61 
 
 
400 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  32.61 
 
 
400 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  28.17 
 
 
411 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  32.88 
 
 
400 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  32.88 
 
 
400 aa  149  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  29.97 
 
 
399 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  30.95 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  30.56 
 
 
418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  28.68 
 
 
411 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 
430 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  30.67 
 
 
406 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 
401 aa  145  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  32.54 
 
 
406 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  30.81 
 
 
415 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  30.51 
 
 
397 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 
398 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  30.66 
 
 
421 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
414 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
426 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  30.77 
 
 
396 aa  143  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 
407 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29931  multidrug ABC transporter  34.44 
 
 
435 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.910726 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  30.03 
 
 
436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  32.09 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  28.23 
 
 
411 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
397 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
408 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  29.1 
 
 
442 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  32.38 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  32.14 
 
 
412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  31.74 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  30.47 
 
 
396 aa  137  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2662  major facilitator superfamily permease  33.43 
 
 
417 aa  136  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  28.49 
 
 
395 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  31.23 
 
 
399 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  30.67 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  31.23 
 
 
399 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  31.23 
 
 
399 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3044  major facilitator transporter  32.43 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>