More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1834 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1834  multidrug resistance protein A  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00170419  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2447  hypothetical protein  84.91 
 
 		 212 aa  371  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3255  multidrug resistance protein A  59.15 
 
 		 217 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4700  hypothetical protein  57.75 
 
 		 217 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000255246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4684  hypothetical protein  58.69 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12554e-48 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4465  hypothetical protein  58.69 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4300  multidrug resistance protein A  58.69 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000026909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4311  multidrug resistance protein A  58.69 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4813  hypothetical protein  58.69 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0590873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4693  hypothetical protein  58.69 
 
 		 217 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4677  hypothetical protein  58.22 
 
 		 217 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0560  hypothetical protein  57.75 
 
 		 217 aa  242  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000264688  hitchhiker  1.67598e-16 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2429  Multidrug resistance efflux pump-like protein  51.16 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.310054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4400  hypothetical protein  56.34 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2910  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  47.42 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2377  hypothetical protein  44.19 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2423  hypothetical protein  44.19 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1945  drug transporter, putative  45.08 
 
 		 215 aa  171  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2323  secretion protein HlyD  39.13 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000671168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4149  hypothetical protein  37.21 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.247441  hitchhiker  0.00000117092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0454  secretion protein HlyD  36.54 
 
 		 217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2016  secretion protein HlyD family protein  37.8 
 
 		 517 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  48.62 
 
 		 373 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 		 373 aa  104  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  33.54 
 
 		 358 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  40.94 
 
 		 325 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  36.61 
 
 		 394 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0099  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  28.71 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 		 366 aa  98.6  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  40.46 
 
 		 400 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 		 351 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  33.77 
 
 		 351 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  37.6 
 
 		 301 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  33.77 
 
 		 351 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36 
 
 		 351 aa  95.5  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  41.46 
 
 		 372 aa  95.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  39.84 
 
 		 331 aa  94.7  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  36.51 
 
 		 352 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  36.51 
 
 		 352 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  41.07 
 
 		 375 aa  94  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  42.28 
 
 		 390 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  39.37 
 
 		 328 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  43.75 
 
 		 344 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.51 
 
 		 352 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 422 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  39.53 
 
 		 346 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  38.24 
 
 		 366 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  39.84 
 
 		 346 aa  93.2  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.51 
 
 		 352 aa  93.6  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  36.43 
 
 		 364 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  39.06 
 
 		 377 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  42.97 
 
 		 344 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  43.52 
 
 		 366 aa  92.8  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  36.51 
 
 		 352 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  38.89 
 
 		 332 aa  92  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  42.5 
 
 		 402 aa  92  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 		 351 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  49 
 
 		 374 aa  91.7  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  45.63 
 
 		 375 aa  91.7  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4102  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 401 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.60829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  33.15 
 
 		 387 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  40.16 
 
 		 387 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  38.28 
 
 		 347 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  39.06 
 
 		 342 aa  89.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4470  secretion protein HlyD family protein  40.83 
 
 		 401 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 		 359 aa  89  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  36.22 
 
 		 347 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  41.22 
 
 		 354 aa  88.6  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  40.16 
 
 		 368 aa  88.6  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  43.09 
 
 		 394 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0618  secretion protein HlyD family protein  41.51 
 
 		 392 aa  88.2  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  43.33 
 
 		 371 aa  88.2  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  44.21 
 
 		 348 aa  88.2  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  37.12 
 
 		 355 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  34.88 
 
 		 390 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  43.33 
 
 		 356 aa  87.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  41.59 
 
 		 371 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0561  secretion protein HlyD family protein  46.15 
 
 		 348 aa  86.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  32.95 
 
 		 377 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  44.44 
 
 		 394 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  45.19 
 
 		 410 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  47.37 
 
 		 400 aa  86.7  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  44.68 
 
 		 360 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  29.17 
 
 		 395 aa  86.3  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0460  multidrug resistance protein  42.34 
 
 		 403 aa  86.7  3e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  43.59 
 
 		 405 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  40.98 
 
 		 383 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5404  secretion protein HlyD family protein  41.67 
 
 		 324 aa  86.3  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  43.52 
 
 		 388 aa  85.9  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  44.04 
 
 		 419 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  45.87 
 
 		 388 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  38.84 
 
 		 385 aa  85.9  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  32.95 
 
 		 377 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 		 393 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  45.26 
 
 		 407 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 351 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  50 
 
 		 351 aa  85.1  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3362  secretion protein HlyD family protein  44.21 
 
 		 413 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  45.65 
 
 		 380 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  34.75 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>