59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1829 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3498  protein of unknown function UPF0236  71.49 
 
 
454 aa  663    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3360  protein of unknown function UPF0236  72.37 
 
 
455 aa  671    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000531623  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1931  protein of unknown function UPF0236  98.25 
 
 
455 aa  934    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1829  protein of unknown function UPF0236  100 
 
 
458 aa  954    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000497336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1615  protein of unknown function UPF0236  72.37 
 
 
455 aa  671    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0133469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1481  protein of unknown function UPF0236  72.15 
 
 
455 aa  669    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1419  protein of unknown function UPF0236  72.37 
 
 
455 aa  671    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000631859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1252  protein of unknown function UPF0236  72.15 
 
 
455 aa  669    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.578671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1055  protein of unknown function UPF0236  72.15 
 
 
455 aa  669    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000029842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0875  protein of unknown function UPF0236  96.07 
 
 
455 aa  913    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0500  protein of unknown function UPF0236  72.37 
 
 
455 aa  671    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0249  protein of unknown function UPF0236  72.15 
 
 
455 aa  669    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2232  hypothetical protein  26.65 
 
 
476 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00123188  unclonable  0.00000000989665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0921  hypothetical protein  26.42 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581224  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2764  protein of unknown function UPF0236  24.08 
 
 
479 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000474396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1683  protein of unknown function UPF0236  24.08 
 
 
479 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1256  protein of unknown function UPF0236  24.08 
 
 
479 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00350537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0892  protein of unknown function UPF0236  24.08 
 
 
479 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0729  protein of unknown function UPF0236  24.08 
 
 
479 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0188  protein of unknown function UPF0236  24.08 
 
 
479 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0092  protein of unknown function UPF0236  24.08 
 
 
479 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0511  protein of unknown function UPF0236  25 
 
 
467 aa  94.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.935045  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08590  hypothetical protein  26.91 
 
 
434 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0643  protein of unknown function UPF0236  23.76 
 
 
467 aa  89.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1993  protein of unknown function UPF0236  23.83 
 
 
467 aa  88.6  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000779773  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0046  protein of unknown function UPF0236  23.68 
 
 
467 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00191865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0420  protein of unknown function UPF0236  23.68 
 
 
467 aa  88.2  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000580166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0770  hypothetical protein  28.48 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1527  hypothetical protein  28.48 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0030  hypothetical protein  28.48 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00177404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0622  hypothetical protein  28.48 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0407627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0981  hypothetical protein  28.48 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1109  hypothetical protein  28.48 
 
 
472 aa  87.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00916427  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1922  hypothetical protein  28.48 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2239  hypothetical protein  28.48 
 
 
472 aa  87.8  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.685977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1954  hypothetical protein  28.48 
 
 
471 aa  87.4  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0069339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0780  hypothetical protein  28.48 
 
 
472 aa  87.4  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0481  protein of unknown function UPF0236  24.39 
 
 
467 aa  87  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.242971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1152  protein of unknown function UPF0236  24.69 
 
 
462 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2444  protein of unknown function UPF0236  24.69 
 
 
462 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2633  protein of unknown function UPF0236  24.69 
 
 
462 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1163  protein of unknown function UPF0236  24.35 
 
 
467 aa  83.2  0.000000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00489953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0363  protein of unknown function UPF0236  24.3 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00218859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08580  hypothetical protein  26.16 
 
 
459 aa  77  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0817  hypothetical protein  28.79 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1837  protein of unknown function UPF0236  23.54 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.95822  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08430  hypothetical protein  25.19 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08860  hypothetical protein  25.19 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000384305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09340  hypothetical protein  25.19 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09850  hypothetical protein  25.19 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12010  hypothetical protein  25.19 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0722624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22880  hypothetical protein  25.19 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07130  hypothetical protein  25.19 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0476  hypothetical protein  23.79 
 
 
460 aa  60.1  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000243771  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0745  hypothetical protein  23.79 
 
 
460 aa  60.1  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0573  hypothetical protein  33.8 
 
 
325 aa  50.1  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1356  hypothetical protein  23.08 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2083  hypothetical protein  27.34 
 
 
187 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1835  hypothetical protein  24.34 
 
 
314 aa  44.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>