More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1828 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
310 aa  615  1e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  65.28 
 
 
294 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  64.24 
 
 
294 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  65.62 
 
 
294 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  65.62 
 
 
294 aa  388  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  65.62 
 
 
294 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  65.97 
 
 
294 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  65.62 
 
 
294 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  64.24 
 
 
295 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3075  EamA family protein  64.93 
 
 
294 aa  368  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  63.54 
 
 
294 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2111  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.25 
 
 
292 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.22 
 
 
311 aa  248  8e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  47.44 
 
 
305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  48.45 
 
 
292 aa  222  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.94 
 
 
307 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.69 
 
 
315 aa  155  8e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0771  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.43 
 
 
286 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.56 
 
 
311 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.953682  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.34 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
309 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 
283 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  26.71 
 
 
293 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  26.64 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.03 
 
 
301 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.6 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 
291 aa  95.9  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.52 
 
 
289 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  28.03 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  28.12 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  28.12 
 
 
303 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  28.12 
 
 
303 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 
283 aa  92.4  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  27.78 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  26.09 
 
 
302 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  27.78 
 
 
303 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  28.12 
 
 
303 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  27.78 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  26.21 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  27.78 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  27.43 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  25.97 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.47 
 
 
315 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  29.89 
 
 
274 aa  89.4  7e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
287 aa  89  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.9 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  24.03 
 
 
324 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  26.88 
 
 
302 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  25.89 
 
 
306 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  26.74 
 
 
297 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  24.22 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.44 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  24.57 
 
 
345 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.78 
 
 
305 aa  85.9  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  28.74 
 
 
330 aa  85.9  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  25.9 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  26.52 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.67 
 
 
317 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  24.75 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.1 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.1 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  25.9 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  25.9 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  22.74 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.81 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  23.63 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  26.06 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0072  hypothetical protein  22.49 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.3 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  24.67 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  26.91 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  24.29 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  26.55 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  24.44 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  26.55 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  24.33 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  26.55 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  24.82 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  23.93 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  27.11 
 
 
317 aa  79  0.00000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.21 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  25.81 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.93 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25.09 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.57 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  23.75 
 
 
296 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  24.92 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  23.73 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.57 
 
 
303 aa  77  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  26.13 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1788  hypothetical protein  26.12 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0875228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.21 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.76 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>