More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1773 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
142 aa  281  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0419  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 
146 aa  120  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2139  MerR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3393  transcriptional regulator, putative  42.22 
 
 
135 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3173  transcriptional regulator  42.22 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3157  MerR family regulatory protein  42.22 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3067  MerR family regulatory protein  42.22 
 
 
135 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3096  MerR family transcriptional regulator  44.68 
 
 
134 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302029  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3397  putative transcriptional regulator  41.27 
 
 
126 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3423  transcriptional regulator  41.27 
 
 
126 aa  87  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3392  putative transcriptional regulator  41.27 
 
 
126 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1854  putative transcriptional regulator  41.27 
 
 
126 aa  87.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3371  putative transcriptional regulator  41.27 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.45 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  38.18 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.18 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  41.12 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  38.05 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  38.53 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  34.07 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  34.35 
 
 
147 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3763  transcriptional regulator, MerR family  48.53 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.503955  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  35.78 
 
 
170 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.19 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.19 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  35.19 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.19 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
147 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  34.78 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  35.45 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  34.43 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 
160 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  31.82 
 
 
158 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  34.48 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  36.07 
 
 
133 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
153 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
138 aa  60.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 
252 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  36.61 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 
135 aa  60.1  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
132 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  34.86 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  32.99 
 
 
191 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  35.96 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  37.61 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  44.93 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  40.19 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  32.11 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
252 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3192  MerR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.375407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1816  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
154 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0245036  normal  0.855302 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  31 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
143 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
267 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
287 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
281 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  30.08 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  34.43 
 
 
132 aa  58.9  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.14 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  35.09 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  30.08 
 
 
171 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.231012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>