More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1733 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  100 
 
 
286 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  51.43 
 
 
291 aa  297  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  50.91 
 
 
291 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  50.91 
 
 
291 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  50.92 
 
 
291 aa  288  8e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  50.18 
 
 
291 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 
280 aa  287  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  50.18 
 
 
291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  50.55 
 
 
291 aa  285  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 
281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  49.47 
 
 
291 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  48.91 
 
 
344 aa  278  8e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
277 aa  189  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
291 aa  188  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  39.33 
 
 
277 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  36.92 
 
 
273 aa  186  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  35.99 
 
 
847 aa  178  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.27 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  37.81 
 
 
278 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  38.41 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  37.59 
 
 
287 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
271 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 
286 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
281 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10740  short chain dehydrogenase  35.31 
 
 
278 aa  169  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.896736  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
285 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 
300 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 
269 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
282 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 
279 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.18 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  37.64 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
271 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  34.86 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  37.14 
 
 
272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.73 
 
 
268 aa  165  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  44.39 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  37.45 
 
 
847 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  40.78 
 
 
274 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  34.91 
 
 
272 aa  163  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  40.78 
 
 
274 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  37.18 
 
 
272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  34.88 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  40.78 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
272 aa  162  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  37.27 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  38.49 
 
 
285 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
274 aa  161  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.27 
 
 
271 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
272 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
282 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 
271 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
267 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
272 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
285 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
307 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
314 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.39 
 
 
287 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
279 aa  159  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3209  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 
268 aa  158  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
268 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
268 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
271 aa  158  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0942  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 
268 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
271 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 
270 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 
277 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.7 
 
 
268 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 
277 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
280 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
273 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 
268 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 
273 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  36.95 
 
 
277 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
286 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 
274 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
272 aa  156  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 
280 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
285 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.43 
 
 
272 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
280 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
280 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
280 aa  155  8e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2186  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.91 
 
 
281 aa  155  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  42.78 
 
 
275 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  43.32 
 
 
276 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
338 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  43.85 
 
 
276 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.46 
 
 
270 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  46.07 
 
 
280 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  39.37 
 
 
284 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
282 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
298 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>