58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1660 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 314 aa  631  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1712  hypothetical protein  75.44 
 
 		 171 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0185  hypothetical protein  32.58 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.823298  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0277  hypothetical protein  32.58 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1766  hypothetical protein  31.74 
 
 		 181 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.362869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3434  hypothetical protein  34.72 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.448749  hitchhiker  0.000000000754153 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2010  hypothetical protein  37 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0296136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1743  hypothetical protein  33.61 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130681  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1983  hypothetical protein  31.9 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2581  blue-copper-protein-like protein  31.67 
 
 		 147 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  29.03 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1910  hypothetical protein  30.38 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1766  hypothetical protein  35.79 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00598249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1904  hypothetical protein  35.79 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000156993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1939  hypothetical protein  35.79 
 
 		 182 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.8907999999999996e-43 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  26.67 
 
 		 151 aa  57  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  30.91 
 
 		 505 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2981  hypothetical protein  37 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  25.83 
 
 		 153 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2981  hypothetical protein  28.7 
 
 		 150 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  28.21 
 
 		 166 aa  53.5  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  27.12 
 
 		 164 aa  53.9  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  25.66 
 
 		 153 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  24.06 
 
 		 156 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  24.82 
 
 		 161 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  24.85 
 
 		 159 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  27.18 
 
 		 167 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  27.84 
 
 		 160 aa  50.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  27.84 
 
 		 163 aa  49.3  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  28.81 
 
 		 159 aa  49.3  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  24.82 
 
 		 167 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  27.84 
 
 		 160 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  23.94 
 
 		 177 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  24.35 
 
 		 153 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  27.64 
 
 		 168 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  28.21 
 
 		 159 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  23.08 
 
 		 156 aa  46.6  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.03 
 
 		 957 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  26.47 
 
 		 157 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  26 
 
 		 176 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  23.94 
 
 		 180 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  28.43 
 
 		 165 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  22.9 
 
 		 189 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  27.03 
 
 		 154 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  28.21 
 
 		 181 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  26.09 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  24.16 
 
 		 175 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  26.02 
 
 		 159 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  25.21 
 
 		 159 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  23.97 
 
 		 169 aa  43.5  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  27.73 
 
 		 160 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  24.16 
 
 		 175 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  27.43 
 
 		 140 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  20.86 
 
 		 159 aa  43.1  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  25.42 
 
 		 162 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  25.42 
 
 		 162 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  22.6 
 
 		 205 aa  42.4  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  25 
 
 		 166 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>