22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1611 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1611  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  183  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.300137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2562  hypothetical protein  80.85 
 
 
99 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3248  hypothetical protein  46.74 
 
 
98 aa  87  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561356  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0294  hypothetical protein  44.21 
 
 
109 aa  86.3  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4899  ATP synthase B chain [imported], putative  45.05 
 
 
100 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  36.56 
 
 
100 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12240  hypothetical protein  35.42 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0646  hypothetical protein  31.58 
 
 
108 aa  57  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000149489  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  37.11 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1171  hypothetical protein  30 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1616  hypothetical protein  32.91 
 
 
102 aa  54.7  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1893  hypothetical protein  35.79 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.546257  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0826  hypothetical protein  30.93 
 
 
104 aa  52  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  31.96 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1004  hypothetical protein  29.47 
 
 
108 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0131469 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1972  hypothetical protein  25.26 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.538462  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2341  hypothetical protein  30.11 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2853  hypothetical protein  27.1 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2538  hypothetical protein  27.1 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  20.21 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2355  hypothetical protein  29.29 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1048  hypothetical protein  33.33 
 
 
92 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.487326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>