268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1582 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  100 
 
 
162 aa  338  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  75.31 
 
 
164 aa  271  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  56.17 
 
 
162 aa  209  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  53.7 
 
 
162 aa  203  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  53.7 
 
 
162 aa  203  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  54.32 
 
 
162 aa  203  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  54.32 
 
 
162 aa  202  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  54.32 
 
 
162 aa  202  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  54.32 
 
 
162 aa  202  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  54.32 
 
 
162 aa  202  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  54.32 
 
 
162 aa  202  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  53.09 
 
 
162 aa  202  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  54.32 
 
 
162 aa  202  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  55.62 
 
 
161 aa  201  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  56.17 
 
 
162 aa  185  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  52.17 
 
 
165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  52.12 
 
 
170 aa  177  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  51.55 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 
161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 
161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 
161 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  50.93 
 
 
165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
171 aa  171  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  51.66 
 
 
173 aa  170  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  48.48 
 
 
169 aa  168  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  49.69 
 
 
166 aa  167  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  48.77 
 
 
166 aa  167  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  49.38 
 
 
159 aa  167  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  50.31 
 
 
166 aa  167  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 
160 aa  167  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  47.8 
 
 
172 aa  166  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  48.08 
 
 
160 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  46.88 
 
 
163 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 
159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  47.2 
 
 
161 aa  164  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  47.5 
 
 
167 aa  163  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
167 aa  163  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  47.5 
 
 
167 aa  163  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  42.26 
 
 
171 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 
160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  45.96 
 
 
164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  50.62 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  49.07 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  46.88 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  46.67 
 
 
167 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1486  dihydrofolate reductase  48.45 
 
 
159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.471201  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1515  dihydrofolate reductase  48.45 
 
 
159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 
160 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 
167 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  47.56 
 
 
170 aa  160  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  46.79 
 
 
160 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 
167 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 
167 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 
167 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  48.12 
 
 
177 aa  159  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 
167 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 
167 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 
176 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 
160 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 
167 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 
160 aa  157  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 
160 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 
160 aa  157  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  45 
 
 
166 aa  157  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 
175 aa  157  7e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  46.34 
 
 
170 aa  157  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  45.51 
 
 
160 aa  157  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  44.97 
 
 
183 aa  157  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 
160 aa  156  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  46.3 
 
 
160 aa  156  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 
166 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  45.68 
 
 
171 aa  155  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 
219 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  47.27 
 
 
169 aa  154  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  44.23 
 
 
160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 
209 aa  154  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 
166 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 
166 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  45.86 
 
 
160 aa  153  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  44.91 
 
 
195 aa  153  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1002  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 
161 aa  152  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64057  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  40.96 
 
 
172 aa  153  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 
195 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  46.91 
 
 
166 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
166 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  44.1 
 
 
163 aa  152  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  43.75 
 
 
160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0603  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 
186 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 
169 aa  151  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  42.86 
 
 
161 aa  150  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 
162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 
170 aa  150  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1581  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 
161 aa  149  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.526666  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  40.36 
 
 
172 aa  149  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 
174 aa  147  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  46.85 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>