76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1547 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1547  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  100 
 
 
238 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2618  cobalt transport protein  50.47 
 
 
242 aa  215  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3822  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.52 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1757  cobalt transport protein  33.85 
 
 
266 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3734  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.34 
 
 
260 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0430563  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0325  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.42 
 
 
255 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1220  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  29.55 
 
 
264 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0184  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  27.48 
 
 
256 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0187  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  27.03 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.95 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1859  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.18 
 
 
257 aa  89  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3658  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.57 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.411896  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0144  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.44 
 
 
268 aa  87  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183976  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0578  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.51 
 
 
254 aa  85.5  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.852275  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1268  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.57 
 
 
259 aa  85.1  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0727  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.34 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197575  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1191  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.2 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2603  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.94 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0562  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.41 
 
 
256 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0095  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.72 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.55 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0576637  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3207  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  24.7 
 
 
259 aa  77  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1698  cobalt ABC transporter CbiQ, inner membrane subunit  26.53 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000031286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0529  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.11 
 
 
258 aa  75.9  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2791  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.23 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295927  decreased coverage  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2733  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.16 
 
 
241 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2593  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.73 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.08926  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2331  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.84 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  26.36 
 
 
599 aa  70.5  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1005  cobalt transport protein  24.78 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2148  cobalt transport protein  30.68 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00358122  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0792  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.38 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1218  cobalt ABC transporter, permease protein  26.43 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1707  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.88 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1295  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.88 
 
 
263 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0707234  normal  0.0195569 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1704  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25 
 
 
262 aa  62.4  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1368  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.66 
 
 
268 aa  59.3  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.744959  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2143  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  21.86 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2197  cobalt ABC transporter permease protein CbiQ  21.86 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2190  cobalt ABC transporter permease CbiQ  21.86 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.757374  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2243  cobalt ABC transporter permease CbiQ  21.86 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2356  cobalt ABC transporter permease CbiQ  21.4 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.208194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1695  cobalt transport protein  27.5 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2563  cobalt transport protein  23.74 
 
 
293 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.121483 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2471  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.39 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1062  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.11 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.104457  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0883  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.15 
 
 
279 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1452  cobalt transport protein  26.4 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0864828  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.56 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000100413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4361  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.5 
 
 
269 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.36 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2761  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.92 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1765  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.57 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00054388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0691  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.52 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1058  cobalt transport protein  25.66 
 
 
311 aa  49.7  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0474  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  27.87 
 
 
250 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1383  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  21.43 
 
 
299 aa  49.3  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.33 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2003  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.82 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.1214e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.1 
 
 
254 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1102  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.56 
 
 
270 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4721  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.12 
 
 
246 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4180  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.48 
 
 
252 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1802  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.61 
 
 
269 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0541  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.6 
 
 
244 aa  45.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3890  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.17 
 
 
254 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1199  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.55 
 
 
270 aa  45.4  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00978481  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.91 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000240215  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.79 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.227232  normal  0.133608 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0091  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.36 
 
 
310 aa  43.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1640  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.4 
 
 
313 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000368028 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1862  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  27.64 
 
 
314 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.144825  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2565  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.32 
 
 
268 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000511957  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1183  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.58 
 
 
265 aa  42.7  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.239886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3591  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  19.07 
 
 
255 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>