83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1526 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1526  uroporphyrinogen-III synthase  100 
 
 
266 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  6.0174e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2640  uroporphyrinogen-III synthase  65.65 
 
 
264 aa  359  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1256  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  31.06 
 
 
387 aa  114  2e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1303  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  31.44 
 
 
387 aa  114  2e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.92794e-08 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3871  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  30.89 
 
 
362 aa  111  1e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323432  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00840  uroporphyrinogen-III synthase  29.92 
 
 
377 aa  108  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0880377  normal  0.206146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4262  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  30.89 
 
 
362 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0253  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  30.42 
 
 
382 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0672  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.21 
 
 
284 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00947107 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1707  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.72 
 
 
281 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.752477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0301  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.5 
 
 
380 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0263  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  30.04 
 
 
382 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0273  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  30.04 
 
 
382 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92823  normal  0.27348 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1325  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  28.63 
 
 
387 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2282  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.01 
 
 
419 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.32035e-05  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1377  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.12 
 
 
378 aa  95.5  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2410  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.78 
 
 
390 aa  95.1  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  1.87789e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2796  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.09 
 
 
381 aa  95.5  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507836  decreased coverage  0.000543328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0354  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.46 
 
 
372 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.07 
 
 
372 aa  94.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.116124  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0380  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  28.35 
 
 
380 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10264  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  28.35 
 
 
381 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.122536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2335  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.74 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3043  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30 
 
 
376 aa  89.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178966  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0793  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  27.52 
 
 
383 aa  88.6  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.649128  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.32 
 
 
381 aa  88.6  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  1.57223e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5922  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  27.7 
 
 
389 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0915623  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0052  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.32 
 
 
261 aa  85.9  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.853888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1494  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  27.52 
 
 
383 aa  84  2e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.99 
 
 
394 aa  84.7  2e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1775  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.23 
 
 
369 aa  83.6  3e-15  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.488954  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.3 
 
 
291 aa  82.8  5e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.95 
 
 
391 aa  80.5  2e-14  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000567169  hitchhiker  5.62153e-06 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4563  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.82 
 
 
281 aa  80.1  3e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.33 
 
 
391 aa  79.7  5e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2720  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.64 
 
 
368 aa  78.2  1e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.210642 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3505  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.27 
 
 
377 aa  77.4  2e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  28.3 
 
 
266 aa  68.2  1e-10  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1109  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.29 
 
 
284 aa  67  3e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1576  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24 
 
 
281 aa  63.5  3e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4165  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25 
 
 
280 aa  63.5  3e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1742  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  24.88 
 
 
435 aa  63.9  3e-09  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.849504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2963  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.51 
 
 
269 aa  63.2  4e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  25.24 
 
 
515 aa  60.8  2e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.86 
 
 
513 aa  61.2  2e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0501  Uroporphyrinogen-III synthase  23.92 
 
 
276 aa  60.5  3e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.90734e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1792  uroporphyrinogen-III synthase  26.54 
 
 
263 aa  58.5  1e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.156972  normal  0.974342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1751  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.79 
 
 
260 aa  57.4  2e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.4 
 
 
505 aa  57  3e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.4 
 
 
491 aa  56.2  6e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0920  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  22.59 
 
 
506 aa  53.9  2e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.62 
 
 
266 aa  52.8  5e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2031  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.51 
 
 
269 aa  52.4  8e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.776715 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.6 
 
 
511 aa  51.6  1e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0493  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.64 
 
 
267 aa  52  1e-05  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0873  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.4 
 
 
255 aa  51.2  2e-05  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0236  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.55 
 
 
528 aa  50.1  4e-05  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2393  uroporphyrinogen III synthase HEM4  23.62 
 
 
277 aa  49.3  7e-05  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.98 
 
 
512 aa  48.9  8e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11620  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.04 
 
 
546 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2012  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.27 
 
 
242 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10522  uroporphyrin-III C-methyltransferase hemD  23.25 
 
 
565 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  23.35 
 
 
512 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6728  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  22.96 
 
 
510 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3299  uroporphyrinogen-III synthase  24.24 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.466839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2897  Uroporphyrinogen-III synthase  24.24 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116607  normal  0.0810585 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  25.73 
 
 
513 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.69 
 
 
506 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1727  uroporphyrinogen III synthase  22.73 
 
 
222 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.198295  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4844  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25 
 
 
520 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1761  uroporphyrinogen III synthase  22.73 
 
 
222 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1106  uroporphyrinogen-III synthase  22.51 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  4.78387e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3179  uroporphyrinogen-III synthase  23.6 
 
 
252 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0846  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.27 
 
 
571 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.75971  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0671  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.27 
 
 
554 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0065  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.27 
 
 
569 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255039  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0678  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.27 
 
 
554 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0691  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.27 
 
 
554 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  20.99 
 
 
509 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.42 
 
 
510 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.01 
 
 
503 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1458  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.51 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  23.14 
 
 
577 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>