85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1505 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  100 
 
 
311 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2661  Endonuclease I  70.68 
 
 
308 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  36.9 
 
 
538 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf874  membrane nuclease  36.69 
 
 
314 aa  94  3e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  36.84 
 
 
539 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  36.88 
 
 
272 aa  92  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  36.24 
 
 
341 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  35.4 
 
 
617 aa  87  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  33.33 
 
 
614 aa  85.9  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  31.55 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  32.62 
 
 
466 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  33.54 
 
 
365 aa  68.9  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  32.53 
 
 
1346 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  32.26 
 
 
1310 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  31.21 
 
 
232 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  28.57 
 
 
275 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  29.45 
 
 
275 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  28.57 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  28.57 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  30.97 
 
 
1503 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  28.57 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  30.73 
 
 
542 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1682  Endonuclease I  29.96 
 
 
267 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  32.14 
 
 
558 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  31.06 
 
 
256 aa  59.7  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  32.14 
 
 
558 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5127  Endonuclease I  29.7 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.745225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  31.85 
 
 
539 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  32.86 
 
 
553 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  27.75 
 
 
442 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0504  Deoxyribonuclease I  30.72 
 
 
233 aa  57  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  29.19 
 
 
388 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0550  endonuclease I precursor  29.94 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3971  deoxyribonuclease I  28.89 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4133  deoxyribonuclease I  32 
 
 
251 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3288  endonuclease I  26.42 
 
 
235 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.961762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3103  endonuclease I  26.42 
 
 
235 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1458  Deoxyribonuclease I  29.84 
 
 
249 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.118773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0769  deoxyribonuclease I  26.42 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000516595  unclonable  0.0000000197257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02775  DNA-specific endonuclease I  26.42 
 
 
235 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.153052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3377  endonuclease I  26.42 
 
 
235 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02738  hypothetical protein  26.42 
 
 
235 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252778  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3256  endonuclease I  26.09 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000148246  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3267  endonuclease I  26.09 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0010351  normal  0.0484419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  28.06 
 
 
596 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40130  deoxyribonuclease I  27.82 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0550387  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3087  endonuclease I  26.42 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00686191  hitchhiker  0.0000298257 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4577  deoxyribonuclease I  29.17 
 
 
243 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.5492500000000006e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03571  endonuclease I  26.92 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3340  endonuclease I  26.09 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00611255  normal  0.202483 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3332  endonuclease I  26.09 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.387366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3436  endonuclease I  26.09 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00127424  hitchhiker  0.00168464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4248  endonuclease I  26.42 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.260828 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0022  extracellular deoxyribonuclease  28.57 
 
 
231 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0750  Deoxyribonuclease I  25.79 
 
 
235 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  28.22 
 
 
323 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0547  Deoxyribonuclease I  31.36 
 
 
232 aa  50.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000480912  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  28.1 
 
 
321 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06200  YurI  29.19 
 
 
657 aa  50.1  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002464  endonuclease I precursor  27.64 
 
 
231 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  30 
 
 
211 aa  49.3  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4599  deoxyribonuclease I  28.33 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.26401e-21  normal  0.918023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3223  deoxyribonuclease I  29.76 
 
 
251 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396495  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4415  deoxyribonuclease I  28.33 
 
 
243 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  8.69182e-28  decreased coverage  0.000909905 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3160  deoxyribonuclease I  27.64 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000648022  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3349  deoxyribonuclease I  25.47 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000315843  decreased coverage  0.00212113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  27.45 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  27.45 
 
 
321 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0833  endonuclease I  28.46 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0691  deoxyribonuclease I  29.27 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000438774  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  29.01 
 
 
219 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48915  predicted protein  35.63 
 
 
516 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02310  Deoxyribonuclease I  29.09 
 
 
268 aa  45.8  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3331  deoxyribonuclease I  28.46 
 
 
257 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0810  deoxyribonuclease I  28.46 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000171872  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3443  endonuclease I  28.46 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000111641  hitchhiker  0.00909149 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0576  deoxyribonuclease I  29.75 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000105466  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3907  Deoxyribonuclease I  28.14 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3525  deoxyribonuclease I  28.46 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000100295  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0835  Deoxyribonuclease I  27.64 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000225063  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2973  deoxyribonuclease I  27.69 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.576725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3709  Deoxyribonuclease I  27.54 
 
 
232 aa  43.5  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1165  EndA/NucM family protease / nuclease  36.62 
 
 
103 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.55589  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0842  deoxyribonuclease I  26.83 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000267909  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0601  deoxyribonuclease I  30.89 
 
 
250 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>