More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1466 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 
835 aa  1732    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  57.72 
 
 
837 aa  1039    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  39.58 
 
 
813 aa  522  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.68 
 
 
813 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  34.65 
 
 
839 aa  481  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  34.37 
 
 
833 aa  479  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  36.32 
 
 
819 aa  463  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  36.26 
 
 
786 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  35.74 
 
 
785 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  34.08 
 
 
863 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.83 
 
 
845 aa  442  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  33.7 
 
 
864 aa  439  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  33.92 
 
 
840 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  34.26 
 
 
793 aa  426  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  33.77 
 
 
871 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.71 
 
 
842 aa  421  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.66 
 
 
845 aa  419  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  32.93 
 
 
823 aa  418  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  32.29 
 
 
837 aa  416  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.95 
 
 
818 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  34.07 
 
 
812 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.89 
 
 
817 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  31.92 
 
 
860 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  30.48 
 
 
897 aa  386  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  32.25 
 
 
847 aa  382  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.57 
 
 
872 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  31.83 
 
 
819 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  31.48 
 
 
831 aa  378  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  32.04 
 
 
819 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  31.63 
 
 
846 aa  368  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  32.34 
 
 
829 aa  365  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  31.18 
 
 
891 aa  365  2e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  31.64 
 
 
824 aa  365  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  30.39 
 
 
824 aa  365  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  30.81 
 
 
891 aa  361  3e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  30.7 
 
 
815 aa  358  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  30.82 
 
 
880 aa  353  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  30.48 
 
 
861 aa  346  8.999999999999999e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  29.48 
 
 
875 aa  344  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  31.62 
 
 
799 aa  336  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  29.96 
 
 
838 aa  336  1e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  30.14 
 
 
802 aa  330  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  29.26 
 
 
843 aa  326  1e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  29.87 
 
 
802 aa  321  3e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.83 
 
 
843 aa  319  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  26.71 
 
 
845 aa  271  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 
763 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  26.2 
 
 
940 aa  248  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  37.98 
 
 
663 aa  221  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3792  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.13 
 
 
826 aa  219  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.296586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4121  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.46 
 
 
826 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2529  Beta-mannosidase  26.01 
 
 
882 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.869345  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5363  glycoside hydrolase family protein  26.27 
 
 
853 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  26.25 
 
 
882 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  26.16 
 
 
816 aa  200  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.15 
 
 
744 aa  198  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.95 
 
 
878 aa  197  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0638  glycosy hydrolase family protein  26.69 
 
 
839 aa  195  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0815  glycosyl hydrolase family protein  26.54 
 
 
839 aa  194  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0039  beta-mannosidase-related protein  26.54 
 
 
839 aa  194  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2885  beta-mannosidase-related protein  26.54 
 
 
839 aa  194  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2200  beta-mannosidase-related protein  26.54 
 
 
839 aa  194  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2507  beta-mannosidase-related protein  26.54 
 
 
839 aa  194  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365324  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0652  glycosy hydrolase family protein  26.54 
 
 
839 aa  194  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1808  Beta-mannosidase  24.32 
 
 
816 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5840  beta-mannosidase  24.68 
 
 
856 aa  190  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0528  beta-mannosidase-related protein  26.87 
 
 
839 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  24.23 
 
 
962 aa  185  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  24.61 
 
 
821 aa  184  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0188  Beta-mannosidase  23.49 
 
 
811 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725753  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4107  beta-mannosidase  24.52 
 
 
812 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653904  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3633  Beta-mannosidase  24.49 
 
 
827 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4156  Beta-mannosidase  24.63 
 
 
828 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4210  Beta-mannosidase  24.63 
 
 
828 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3307  Beta-mannosidase  24.63 
 
 
828 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.33 
 
 
984 aa  177  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6019  mannosidase  22.78 
 
 
820 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4395  beta-mannosidase  23.91 
 
 
825 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 
734 aa  160  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0255  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.24 
 
 
720 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.381265 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  22.49 
 
 
906 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.6 
 
 
971 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  24.92 
 
 
739 aa  135  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  24.17 
 
 
724 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1074  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  22.76 
 
 
815 aa  120  9e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822131  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  27.18 
 
 
1144 aa  117  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.5 
 
 
1362 aa  110  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  25.12 
 
 
803 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  24.61 
 
 
925 aa  95.9  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  26.49 
 
 
972 aa  94.7  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.84 
 
 
1781 aa  93.2  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  25.95 
 
 
889 aa  92.4  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.68 
 
 
884 aa  92.4  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0081  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.43 
 
 
808 aa  92.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.15 
 
 
923 aa  90.1  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  23.65 
 
 
859 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0804  glycoside hydrolase family protein  24.69 
 
 
858 aa  87.4  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0992  glycoside hydrolase family protein  24.63 
 
 
932 aa  86.7  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0295666  normal  0.0129496 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.21 
 
 
805 aa  87.4  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  22.31 
 
 
1029 aa  85.1  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>