136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1302 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  100 
 
 		 634 aa  1283    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.44 
 
 		 616 aa  394  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3445  hypothetical protein  38.1 
 
 		 628 aa  360  4e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.919866  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2994  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.56 
 
 		 608 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0630  hypothetical protein  41.97 
 
 		 513 aa  277  5e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2624  hypothetical protein  40.39 
 
 		 505 aa  269  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0046  GTP-binding protein LepA  48.97 
 
 		 276 aa  150  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0304076  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2518  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.31 
 
 		 613 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215068  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2740  hypothetical protein  51.41 
 
 		 150 aa  137  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.3 
 
 		 607 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3087  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.26 
 
 		 605 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0545  ATP-dependent OLD family endonuclease  21.34 
 
 		 615 aa  75.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0505  ATP-dependent endonuclease, OLD family protein  22.13 
 
 		 663 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0949649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4711  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  23.05 
 
 		 648 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  24.18 
 
 		 594 aa  63.9  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1915  ATP-dependent endonuclease of the OLD family- like protein  28.86 
 
 		 529 aa  62.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1516  ATP-dependent endonuclease family protein  25.79 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.749e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  26.21 
 
 		 688 aa  58.9  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1596  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.54 
 
 		 652 aa  58.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  23.38 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2759  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.62 
 
 		 608 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  27.31 
 
 		 564 aa  57.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  30.19 
 
 		 452 aa  56.6  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  23.18 
 
 		 613 aa  56.2  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3185  ATP-dependent endonuclease family protein  27.56 
 
 		 641 aa  56.2  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4153  SMC domain-containing protein  24.73 
 
 		 574 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910063 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1387  ATP-dependent OLD family endonuclease  20.9 
 
 		 550 aa  55.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.398618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  27.38 
 
 		 607 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0004  DNA replication and repair protein RecF  43.14 
 
 		 353 aa  54.3  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000383314  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2250  recombination protein F  43.48 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.122677 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  23.53 
 
 		 594 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3047  ATP-dependent endonuclease family protein  31 
 
 		 598 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300622  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  40.85 
 
 		 448 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0307  SMC domain protein  40.85 
 
 		 448 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1535  RloH  24.74 
 
 		 588 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000290266  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3949  hypothetical protein  38.96 
 
 		 877 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.028786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.64 
 
 		 708 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4848  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.33 
 
 		 626 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4641  ATP-dependent endonuclease  34.18 
 
 		 626 aa  52  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3934  hypothetical protein  38.96 
 
 		 877 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4008  hypothetical protein  38.96 
 
 		 877 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0673  ATP-dependent endonuclease family protein  25.64 
 
 		 619 aa  52  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.924756 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0257  hypothetical protein  35.44 
 
 		 159 aa  52  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00160125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  21.11 
 
 		 598 aa  51.6  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  32 
 
 		 640 aa  52  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  22.73 
 
 		 669 aa  51.2  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2540  hypothetical protein  22.83 
 
 		 593 aa  51.6  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  23.57 
 
 		 714 aa  51.2  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  27.27 
 
 		 566 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2248  recombination protein F  47.83 
 
 		 377 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  33.64 
 
 		 623 aa  50.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2374  DNA replication and repair protein RecF  35.29 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.39 
 
 		 548 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2588  SMC domain protein  43.14 
 
 		 687 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.326587  normal  0.642403 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  33.33 
 
 		 653 aa  49.3  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0042  hypothetical protein  24.3 
 
 		 634 aa  49.7  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  40.35 
 
 		 604 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4083  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.1 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186045  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  23.73 
 
 		 553 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2256  hypothetical protein  39.02 
 
 		 883 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  29.21 
 
 		 789 aa  49.3  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  32.71 
 
 		 1170 aa  49.7  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02258  hypothetical protein  37.88 
 
 		 626 aa  49.7  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  29.25 
 
 		 1170 aa  49.7  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  38.3 
 
 		 478 aa  48.5  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3056  ATP-dependent endonuclease family protein  28 
 
 		 598 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  34.69 
 
 		 773 aa  48.9  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  24.29 
 
 		 696 aa  48.5  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5273  recombination protein F  43.48 
 
 		 384 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0402761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11304  hypothetical protein  40.98 
 
 		 875 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  29.63 
 
 		 580 aa  48.5  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3672  hypothetical protein  43.75 
 
 		 378 aa  48.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6288  DNA repair ATPase-like protein  31.67 
 
 		 644 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0357583  normal  0.430633 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1111  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.18 
 
 		 603 aa  47.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4435  hypothetical protein  37.8 
 
 		 885 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.149901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0004  recombination protein F  45.65 
 
 		 374 aa  47.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1218  SMC domain protein  38.78 
 
 		 877 aa  47.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1135  hypothetical protein  26.02 
 
 		 447 aa  47.8  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.879789  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  25.93 
 
 		 1003 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  38.96 
 
 		 1008 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  27.63 
 
 		 394 aa  47.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  26.8 
 
 		 584 aa  47.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1846  ATP-dependent OLD family endonuclease  33.63 
 
 		 589 aa  47.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147928 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  29.47 
 
 		 537 aa  47.4  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  31.15 
 
 		 581 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0004  recombination protein F  45.65 
 
 		 372 aa  47.4  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  34.62 
 
 		 758 aa  47.4  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1420  hypothetical protein  38.6 
 
 		 874 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  34.44 
 
 		 1061 aa  46.6  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  26.09 
 
 		 610 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0870  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.98 
 
 		 591 aa  47  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  23.98 
 
 		 647 aa  46.6  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3801  SMC domain-containing protein  44 
 
 		 682 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0420971  hitchhiker  0.000733932 
 
 
-
 
NC_002620  TC0346  recombination protein F  43.14 
 
 		 365 aa  46.2  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  26.19 
 
 		 650 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1061  hypothetical protein  34.48 
 
 		 712 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00298037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2338  hypothetical protein  36.84 
 
 		 874 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000220057  unclonable  0.000000361106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  44.44 
 
 		 439 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  31.82 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0225  ATP-dependent OLD family endonuclease  22.06 
 
 		 578 aa  46.2  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140656 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>