More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1280 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  66.8 
 
 		 493 aa  667    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 492 aa  1013    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  21.77 
 
 		 530 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  22.7 
 
 		 515 aa  94  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  31.63 
 
 		 537 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 430 aa  90.9  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  40.17 
 
 		 513 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 283 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 278 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 283 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  40.48 
 
 		 278 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  40.48 
 
 		 278 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 548 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.37 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  39.37 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  39.37 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  39.37 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  36.75 
 
 		 519 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 1201 aa  80.9  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 259 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 517 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  32.82 
 
 		 502 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3661  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  37.84 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0868  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3531  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 550 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  38.61 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 253 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  21.9 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  32.08 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0868  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  37.62 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  37.62 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  37.62 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  37.62 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 529 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 533 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 302 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  34.23 
 
 		 251 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  41.38 
 
 		 241 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3084  response regulator receiver protein  24.44 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 538 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.6 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  36.46 
 
 		 1296 aa  70.5  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 532 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  32.06 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  26.06 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4762  transcriptional regulator, AraC family  32.45 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0640871  normal  0.0124247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1711  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.0412412 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 532 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  36.04 
 
 		 1378 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.08 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.08 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 310 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.08 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  27.08 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 259 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  30.53 
 
 		 745 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4009  helix-turn-helix domain-containing protein  31.91 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125602  normal  0.35131 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  30.53 
 
 		 745 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  34.34 
 
 		 287 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05185  hypothetical protein  32.76 
 
 		 280 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.08 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.08 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.08 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001306  putative ARAC-type regulatory protein  31.9 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4141  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0368552 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 544 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1337  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 600 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4513  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>