More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1273 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0724  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  59.13 
 
 
593 aa  712    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0623  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  59.13 
 
 
593 aa  710    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0567  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  59.01 
 
 
592 aa  693    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0566  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  59.13 
 
 
593 aa  713    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0551  extracellular solute-binding protein  60.27 
 
 
591 aa  728    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  59.86 
 
 
591 aa  713    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
593 aa  1214    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0656  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  59.13 
 
 
593 aa  710    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0713  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  59.13 
 
 
593 aa  710    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0785  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  58.96 
 
 
593 aa  709    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0779  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  40.72 
 
 
590 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00616067  hitchhiker  0.000000000000014746 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1115  extracellular solute-binding protein family 5  42.18 
 
 
596 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1116  extracellular solute-binding protein family 5  38.95 
 
 
592 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0728  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  39.18 
 
 
591 aa  409  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.414053 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0778  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  38.79 
 
 
605 aa  410  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000335108  hitchhiker  0.00000000000176984 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1666  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  42.52 
 
 
467 aa  363  5.0000000000000005e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1009  extracellular solute-binding protein  37.52 
 
 
571 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0990  extracellular solute-binding protein  37.52 
 
 
571 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1615  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  36.48 
 
 
596 aa  323  4e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.176956  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D17  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  33 
 
 
600 aa  280  5e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2026  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  32.51 
 
 
600 aa  265  3e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00409621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  30.81 
 
 
557 aa  235  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  32.99 
 
 
579 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  32.85 
 
 
580 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  27.51 
 
 
573 aa  219  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  29.15 
 
 
574 aa  213  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  27.21 
 
 
572 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 
575 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1768  extracellular solute-binding protein family 5  32.84 
 
 
579 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000449992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.97 
 
 
575 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  31 
 
 
575 aa  188  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0241  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  30.63 
 
 
575 aa  188  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  32.61 
 
 
575 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.38 
 
 
540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0231  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  32.21 
 
 
555 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0248  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein, putative  32.29 
 
 
575 aa  183  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  29.65 
 
 
575 aa  183  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  29.82 
 
 
575 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0218  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  32.35 
 
 
559 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  29.72 
 
 
575 aa  176  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
567 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  28.32 
 
 
566 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.2 
 
 
567 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
559 aa  161  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 
593 aa  158  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  27.18 
 
 
546 aa  153  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 
622 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 
539 aa  150  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.19 
 
 
524 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4386  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.63 
 
 
529 aa  148  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.775513  hitchhiker  3.14637e-22 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  28.93 
 
 
526 aa  147  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1000  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.87 
 
 
529 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  25.61 
 
 
541 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0858  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.63 
 
 
528 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000478589  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0807  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.87 
 
 
528 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000107652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0908  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.63 
 
 
528 aa  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000813115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0996  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.87 
 
 
528 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.41324e-61 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
540 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0822  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.69 
 
 
528 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0945  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.46 
 
 
528 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00751792  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1273  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  23.82 
 
 
531 aa  143  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0104885  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0930  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.34 
 
 
588 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.476779  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0803  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
529 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000165149  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  26.53 
 
 
535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
538 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
565 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0398  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.39 
 
 
527 aa  141  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03395  dipeptide transporter  25.38 
 
 
535 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0168  4-phytase  25.38 
 
 
535 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0171  4-phytase  25.38 
 
 
535 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3744  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.38 
 
 
535 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4037  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.38 
 
 
535 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.38 
 
 
535 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03346  hypothetical protein  25.38 
 
 
535 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3863  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.38 
 
 
535 aa  140  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 
526 aa  140  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
535 aa  139  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 
512 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0093  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
604 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
588 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4719  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
591 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.42042  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0337  extracellular solute-binding protein family 5  25.87 
 
 
581 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.29 
 
 
526 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.82 
 
 
510 aa  136  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 
617 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.75 
 
 
538 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  23.32 
 
 
628 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  26.87 
 
 
510 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.1 
 
 
526 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.1 
 
 
526 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.1 
 
 
526 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  24.9 
 
 
535 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  25.13 
 
 
554 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0504  ABC transporter substrate-binding protein  32.36 
 
 
531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.325614  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.16 
 
 
516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.69 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0146  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.16 
 
 
539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.29775 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  25.69 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.1 
 
 
526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.07 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>