More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1219 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 
503 aa  1003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  80.12 
 
 
498 aa  806  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  60.59 
 
 
505 aa  618  1e-176  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  60.4 
 
 
504 aa  612  1e-174  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.83656e-05 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  60.2 
 
 
505 aa  612  1e-174  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  60.4 
 
 
505 aa  612  1e-174  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  60.2 
 
 
505 aa  612  1e-174  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  60.2 
 
 
504 aa  612  1e-174  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  60.2 
 
 
505 aa  612  1e-174  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  60.2 
 
 
505 aa  612  1e-174  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  60.2 
 
 
505 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  60.2 
 
 
505 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  59.41 
 
 
504 aa  602  1e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  59.39 
 
 
523 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  52.68 
 
 
516 aa  547  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.02789e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  53.4 
 
 
532 aa  543  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  52.49 
 
 
516 aa  543  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  52.49 
 
 
516 aa  539  1e-152  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.0169e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  52.49 
 
 
516 aa  539  1e-152  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  52.8 
 
 
516 aa  541  1e-152  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  1.5754e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  52.49 
 
 
516 aa  538  1e-152  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.13352e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  52.49 
 
 
516 aa  539  1e-152  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  52.09 
 
 
516 aa  537  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.51893e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  52.29 
 
 
516 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  52.29 
 
 
516 aa  538  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  50.51 
 
 
490 aa  482  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  49.08 
 
 
531 aa  475  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  50.22 
 
 
659 aa  472  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  50.2 
 
 
508 aa  473  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  50.33 
 
 
659 aa  471  1e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  51.81 
 
 
546 aa  465  1e-130  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  51.28 
 
 
506 aa  466  1e-130  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  48.89 
 
 
497 aa  464  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  50.2 
 
 
548 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  50.2 
 
 
548 aa  463  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  2.12445e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  47.79 
 
 
494 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  45.84 
 
 
577 aa  446  1e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  48.46 
 
 
531 aa  442  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  52.09 
 
 
525 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  44.44 
 
 
573 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  46.99 
 
 
520 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  46.99 
 
 
520 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  44.75 
 
 
583 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  45.51 
 
 
551 aa  425  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  44.87 
 
 
600 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  45.45 
 
 
530 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  42.51 
 
 
530 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  43.96 
 
 
573 aa  425  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  46.32 
 
 
637 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  46.22 
 
 
542 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  1.08541e-06 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  44.97 
 
 
573 aa  416  1e-115  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  42.8 
 
 
610 aa  416  1e-115  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  48.93 
 
 
525 aa  415  1e-115  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  50 
 
 
514 aa  418  1e-115  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  45.89 
 
 
526 aa  417  1e-115  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  47.19 
 
 
545 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  44.78 
 
 
657 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  45.69 
 
 
646 aa  409  1e-113  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  46.41 
 
 
606 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  42.97 
 
 
585 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  43.29 
 
 
574 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  45.59 
 
 
685 aa  411  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  45.89 
 
 
550 aa  406  1e-112  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  47.4 
 
 
524 aa  405  1e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  42.52 
 
 
582 aa  406  1e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  42.52 
 
 
582 aa  406  1e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  42.8 
 
 
582 aa  408  1e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  45.4 
 
 
544 aa  406  1e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  46.05 
 
 
660 aa  408  1e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  47.6 
 
 
658 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  48.39 
 
 
682 aa  405  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  46.75 
 
 
533 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  47.1 
 
 
682 aa  403  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  43.82 
 
 
556 aa  400  1e-110  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  43.68 
 
 
538 aa  401  1e-110  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  43.29 
 
 
661 aa  400  1e-110  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  43.94 
 
 
603 aa  399  1e-110  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2719  choline/carnitine/betaine transporter  46.51 
 
 
658 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  45.77 
 
 
606 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  41.78 
 
 
582 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1122  transporter, BCCT family protein  50.88 
 
 
515 aa  396  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2552  choline/carnitine/betaine transporter  46.51 
 
 
658 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000125111  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  44.44 
 
 
580 aa  395  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  41.54 
 
 
580 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  46.51 
 
 
658 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  46.51 
 
 
658 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  46.51 
 
 
658 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  44.73 
 
 
661 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2619  choline/carnitine/betaine transporter  46.72 
 
 
658 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  9.08403e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  43.46 
 
 
644 aa  393  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  41.05 
 
 
667 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  43.44 
 
 
583 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  40.7 
 
 
582 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  47.33 
 
 
673 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  43.41 
 
 
656 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1546  choline/carnitine/betaine transporter  46.29 
 
 
658 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  40.31 
 
 
581 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  47.35 
 
 
687 aa  388  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  42.64 
 
 
538 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  43.75 
 
 
642 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>