More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1160 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
89 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  92.13 
 
 
89 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 
89 aa  159  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 
89 aa  159  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 
89 aa  159  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 
89 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 
89 aa  159  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 
89 aa  159  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 
89 aa  159  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 
89 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 
89 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 
89 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 
89 aa  159  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 
89 aa  143  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 
89 aa  143  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 
89 aa  138  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  73.03 
 
 
89 aa  135  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  71.91 
 
 
89 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  71.91 
 
 
89 aa  133  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  70.79 
 
 
89 aa  131  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  71.26 
 
 
88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  66.29 
 
 
89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  69.66 
 
 
89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  70.11 
 
 
88 aa  127  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  67.42 
 
 
89 aa  127  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  67.42 
 
 
89 aa  126  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 
88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  68.6 
 
 
88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 
88 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1171  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000173887  hitchhiker  0.0000000000423662 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 
87 aa  124  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  67.42 
 
 
89 aa  124  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  124  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 
88 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  123  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  67.82 
 
 
88 aa  123  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 
89 aa  122  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  64.04 
 
 
89 aa  122  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  64.37 
 
 
87 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0648  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  67.42 
 
 
89 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  121  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 
88 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  65.52 
 
 
88 aa  120  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  120  6e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  65.12 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  69.05 
 
 
88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0202  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  118  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3587  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  118  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  69.88 
 
 
87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  69.88 
 
 
87 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 
89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0718  ribosomal protein S15  63.95 
 
 
88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000223942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  117  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  117  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  116  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2074  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  115  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.446463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4383  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0948  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3631  ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0462627  normal  0.0107492 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1485  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
90 aa  114  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0180662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1439  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
90 aa  114  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000011609  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  115  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  62.5 
 
 
90 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0177  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  113  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10950  SSU ribosomal protein S15P  56.82 
 
 
95 aa  113  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0134595  unclonable  0.00000000142351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0173  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.401011  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1994  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0200554  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  113  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2117  ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0620683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1667  ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03032  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0540  ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3357  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3649  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0533  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5458  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.259891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1030  ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168108  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02983  hypothetical protein  60.67 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>