More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1128 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 
257 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2020  flagellar biosynthesis protein FliR  64.45 
 
 
257 aa  254  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  40 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  41.63 
 
 
260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  37.5 
 
 
259 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  39.18 
 
 
255 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  36.19 
 
 
253 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  37.23 
 
 
261 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  38.3 
 
 
255 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  37.08 
 
 
255 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  34.75 
 
 
260 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  34.01 
 
 
261 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  30 
 
 
265 aa  139  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  32.03 
 
 
260 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  34.04 
 
 
254 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1313  flagellar biosynthesis protein FliR  33.2 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.518612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  33.2 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.894574  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  34.29 
 
 
261 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0550  flagellar biosynthesis protein FliR  33.2 
 
 
255 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.826855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  34.69 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  35.98 
 
 
253 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  33.06 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  34.41 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  35.66 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  32.66 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  30.71 
 
 
264 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  32.07 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  35.14 
 
 
260 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  32.65 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0850  flagellar biosynthetic protein FliR  34.42 
 
 
254 aa  125  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  35.14 
 
 
253 aa  125  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  33.17 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  31.42 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  34.62 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  33.73 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  32.31 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  32.74 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  33.01 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  34.39 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  34.42 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  28.93 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  31.58 
 
 
252 aa  112  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  30.34 
 
 
261 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  30.57 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  28.92 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  31.47 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  32.1 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  32.37 
 
 
257 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  28.98 
 
 
258 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  28.63 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  29.07 
 
 
255 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  29.55 
 
 
247 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  30.08 
 
 
260 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  30.77 
 
 
240 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  29.71 
 
 
256 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  30.84 
 
 
255 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  33.03 
 
 
263 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  29.76 
 
 
258 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  30.22 
 
 
260 aa  105  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  33.96 
 
 
266 aa  104  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  28.46 
 
 
261 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  29.39 
 
 
256 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  34.36 
 
 
239 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  26.78 
 
 
264 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  27.56 
 
 
260 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  28.29 
 
 
267 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  27.56 
 
 
260 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  27.56 
 
 
260 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  33.49 
 
 
259 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  28.32 
 
 
260 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1700  flagellar biosynthetic protein FliR  30.33 
 
 
269 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000123329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0065  flagellar protein FliR  30.33 
 
 
269 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  31.82 
 
 
256 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  29.96 
 
 
255 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  32.78 
 
 
264 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  28.95 
 
 
255 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  29.09 
 
 
247 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  29.09 
 
 
256 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  25.99 
 
 
253 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  33.81 
 
 
252 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  28.4 
 
 
261 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  30.13 
 
 
257 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  28.74 
 
 
260 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  29.15 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  28.98 
 
 
260 aa  99  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  27.42 
 
 
256 aa  99  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0256175  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0017  flagellar biosynthetic protein FliR  27.42 
 
 
256 aa  99  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0289665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  27.31 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1668  flagellar biosynthetic protein FliR  34.3 
 
 
274 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0291924  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  29.8 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  27.95 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  26.91 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  27.59 
 
 
260 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  25.31 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  28.14 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  30.88 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  28.16 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  26.48 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  29.15 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  26.32 
 
 
260 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>