More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1096 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  100 
 
 		 277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  61.72 
 
 		 257 aa  333  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  60.94 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  61.33 
 
 		 257 aa  315  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  61.33 
 
 		 257 aa  308  8e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  61.33 
 
 		 257 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  61.33 
 
 		 257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  60.94 
 
 		 257 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  60.78 
 
 		 257 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  60.78 
 
 		 257 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  60.55 
 
 		 257 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  60.16 
 
 		 257 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2489  ribonuclease HII  62.4 
 
 		 259 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000648841  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  49.8 
 
 		 253 aa  244  8e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  48.41 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1415  ribonuclease HII  52.36 
 
 		 258 aa  238  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000335536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  58.38 
 
 		 256 aa  235  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0777  ribonuclease HII  44.14 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1303  ribonuclease HII  48.81 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00555633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1328  ribonuclease HII  48.81 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  47.43 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  53.28 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3752  ribonuclease HII  48.45 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719683  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  47.6 
 
 		 250 aa  228  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  53.62 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  46.83 
 
 		 308 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  47.47 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  42.86 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  50.75 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  47.96 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  51.79 
 
 		 219 aa  202  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2865  ribonuclease HII  51.5 
 
 		 213 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000377416  hitchhiker  0.000000754237 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  51.76 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  51.79 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  48.2 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  50 
 
 		 214 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  50.49 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  53.3 
 
 		 208 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  49.51 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  50.52 
 
 		 210 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  47.55 
 
 		 204 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  37.4 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  48 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  50.5 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1991  Ribonuclease H  47.37 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057081  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  49.48 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  50 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  45.18 
 
 		 283 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  41.13 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  45.69 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  52.2 
 
 		 203 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  51.4 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  51.09 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  48.78 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  51.09 
 
 		 209 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  46.19 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  49.47 
 
 		 212 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3486  ribonuclease HII  49.51 
 
 		 230 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.83374e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0649  ribonuclease HII  51.24 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  49.74 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  39.92 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  47.5 
 
 		 207 aa  179  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  54.55 
 
 		 199 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  51.23 
 
 		 227 aa  178  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  48.65 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  45.63 
 
 		 211 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  49.73 
 
 		 204 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 208 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3003  ribonuclease HII  51.53 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0796638  normal  0.60984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3045  ribonuclease HII  51.53 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  47.74 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  48.09 
 
 		 199 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  50.57 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  46.52 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  49.46 
 
 		 199 aa  174  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  48.42 
 
 		 201 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  47.42 
 
 		 210 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  49.2 
 
 		 201 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 218 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  48.65 
 
 		 193 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  48.69 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  43.14 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0628  ribonuclease H  42.03 
 
 		 210 aa  171  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  47.89 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  36.08 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  47.62 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  49 
 
 		 224 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50.27 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  46.91 
 
 		 208 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0224  ribonuclease H  46.5 
 
 		 207 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000335497  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  49.45 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  46.35 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  46.35 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>