More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1065 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 		 364 aa  759    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  88.55 
 
 		 365 aa  676    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  76.65 
 
 		 362 aa  599  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  75.69 
 
 		 362 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  75.69 
 
 		 362 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  75.69 
 
 		 362 aa  595  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  75.69 
 
 		 362 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  75.69 
 
 		 362 aa  595  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  75.69 
 
 		 362 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  75.41 
 
 		 362 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  75.41 
 
 		 362 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  75.41 
 
 		 362 aa  592  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  75.41 
 
 		 362 aa  592  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.75 
 
 		 364 aa  548  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.46 
 
 		 364 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.46 
 
 		 364 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  61.06 
 
 		 348 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.39 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  57.82 
 
 		 368 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.82 
 
 		 342 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0188  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  56.21 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  51.74 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.71 
 
 		 347 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.71 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  53.71 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  53.17 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  50.3 
 
 		 349 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  51.91 
 
 		 360 aa  357  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.11 
 
 		 349 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  48.1 
 
 		 351 aa  346  4e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  48.66 
 
 		 348 aa  335  9e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  48.96 
 
 		 349 aa  335  9e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4182  radical SAM protein  48.32 
 
 		 374 aa  329  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.29 
 
 		 349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.2 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.2 
 
 		 343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  46.98 
 
 		 318 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  46.36 
 
 		 408 aa  312  6.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.73 
 
 		 363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  43.82 
 
 		 371 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0444  hypothetical protein  43.15 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4731  radical SAM enzyme, Cfr family  42.49 
 
 		 350 aa  293  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.698724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0665  radical SAM enzyme, Cfr family  42.77 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2184  radical SAM enzyme, Cfr family  40.62 
 
 		 382 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  43.02 
 
 		 372 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  42.77 
 
 		 354 aa  288  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000883258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  43.6 
 
 		 351 aa  288  9e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.48 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1361  radical SAM enzyme, Cfr family  42.45 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  41.87 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  43.31 
 
 		 372 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  43.02 
 
 		 372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.19 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5022  radical SAM protein  41.06 
 
 		 397 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2087  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.9 
 
 		 356 aa  286  4e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122222  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  42.18 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  41.55 
 
 		 382 aa  285  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.34 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0648  hypothetical protein  41.74 
 
 		 413 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  40.97 
 
 		 357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3115  radical SAM enzyme, Cfr family  43.2 
 
 		 353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.248396  hitchhiker  0.0000000842526 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1758  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.62 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.57 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  39.72 
 
 		 373 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  40.45 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  42.12 
 
 		 382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0679  hypothetical protein  41.46 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3124  hypothetical protein  41.74 
 
 		 365 aa  282  6.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.347966 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0620  hypothetical protein  42.4 
 
 		 370 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.180215  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2093  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.02 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1869  radical SAM protein  41.74 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  40.11 
 
 		 376 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2063  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.98 
 
 		 351 aa  280  4e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.029616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  39.63 
 
 		 399 aa  279  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.86 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.88 
 
 		 354 aa  279  5e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0906  radical SAM enzyme, Cfr family  42.77 
 
 		 356 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1905  radical SAM protein  41.43 
 
 		 403 aa  277  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.79 
 
 		 347 aa  277  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  39.22 
 
 		 375 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.97 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40.05 
 
 		 399 aa  276  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1388  radical SAM enzyme, Cfr family  43.62 
 
 		 462 aa  276  5e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000126812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0210  radical SAM enzyme, Cfr family  40.29 
 
 		 367 aa  275  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  42.11 
 
 		 377 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.06 
 
 		 361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1468  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.28 
 
 		 340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0083  radical SAM protein  38.84 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2191  radical SAM enzyme, Cfr family  41.08 
 
 		 392 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3855  radical SAM enzyme, Cfr family  42.18 
 
 		 348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.74079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1249  radical SAM protein  39.23 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.54 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07736  hypothetical protein  40.53 
 
 		 346 aa  273  3e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.161739  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28470  radical SAM enzyme, Cfr family  39.71 
 
 		 344 aa  273  3e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.267861  hitchhiker  0.00294853 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.37 
 
 		 371 aa  273  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  40.87 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1442  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.28 
 
 		 340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0426  radical SAM enzyme, Cfr family  39.94 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0483  radical SAM enzyme, Cfr family  40.92 
 
 		 350 aa  272  5.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0926837  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2089  hypothetical protein  39.38 
 
 		 384 aa  272  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>